NUP133

NUP133
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XKS, 3CQC, 3CQG, 3I4R, 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	NUP133, hnucleoporin 133kDa, nucleoporin 133, NPHS18, GAMOS8
Зовнішні ІД	OMIM: 607613 MGI: 2442620 HomoloGene: 32402 GeneCards: NUP133
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear envelope • хромосома • центромера • кінетохор • мембрана • гіалоплазма • outer kinetochore • Ядерна мембрана • Ядерна пора • nuclear pore outer ring • host cell Біологічний процес • protein import into nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • Нейрогенез • neural tube development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral transcription • mRNA transport • regulation of cellular response to heat • paraxial mesoderm development • mitotic nuclear membrane disassembly • nuclear pore organization • protein sumoylation • somite development • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55746	234865
Ensembl	ENSG00000069248	ENSMUSG00000039509
UniProt	Q8WUM0	Q8R0G9
RefSeq (мРНК)	NM_018230	NM_172288
RefSeq (білок)	NP_060700	NP_758492
Локус (UCSC)	Хр. 1: 229.44 – 229.51 Mb	Хр. 8: 124.62 – 124.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP133 (англ. Nucleoporin 133) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 156 амінокислот, а молекулярна маса — 128 979.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPAAPSPRT		PGTGSRRGPL		AGLGPGSTPR		TASRKGLPLG		SAVSSPVLFS
PVGRRSSLSS		RGTPTRMFPH		HSITESVNYD		VKTFGSSLPV		KVMEALTLAE
VDDQLTINID		EGGWACLVCK		EKLIIWKIAL		SPITKLSVCK		ELQLPPSDFH
WSADLVALSY		SSPSGEAHST		QAVAVMVATR		EGSIRYWPSL		AGEDTYTEAF
VDSGGDKTYS		FLTAVQGGSF		ILSSSGSQLI		RLIPESSGKI		HQHILPQGQG
MLSGIGRKVS		SLFGILSPSS		DLTLSSVLWD		RERSSFYSLT		SSNISKWELD
DSSEKHAYSW		DINRALKENI		TDAIWGSESN		YEAIKEGVNI		RYLDLKQNCD
GLVILAAAWH		SADNPCLIYY		SLITIEDNGC		QMSDAVTVEV		TQYNPPFQSE
DLILCQLTVP		NFSNQTAYLY		NESAVYVCST		GTGKFSLPQE		KIVFNAQGDS
VLGAGACGGV		PIIFSRNSGL		VSITSRENVS		ILAEDLEGSL		ASSVAGPNSE
SMIFETTTKN		ETIAQEDKIK		LLKAAFLQYC		RKDLGHAQMV		VDELFSSHSD
LDSDSELDRA		VTQISVDLMD		DYPASDPRWA		ESVPEEAPGF		SNTSLIILHQ
LEDKMKAHSF		LMDFIHQVGL		FGRLGSFPVR		GTPMATRLLL		CEHAEKLSAA
IVLKNHHSRL		SDLVNTAILI		ALNKREYEIP		SNLTPADVFF		REVSQVDTIC
ECLLEHEEQV		LRDAPMDSIE		WAEVVINVNN		ILKDMLQAAS		HYRQNRNSLY
RREESLEKEP		EYVPWTATSG		PGGIRTVIIR		QHEIVLKVAY		PQADSNLRNI
VTEQLVALID		CFLDGYVSQL		KSVDKSSNRE		RYDNLEMEYL		QKRSDLLSPL
LSLGQYLWAA		SLAEKYCDFD		ILVQMCEQTD		NQSRLQRYMT		QFADQNFSDF
LFRWYLEKGK		RGKLLSQPIS		QHGQLANFLQ		AHEHLSWLHE		INSQELEKAH
ATLLGLANME		TRYFAKKKTL		LGLSKLAALA		SDFSEDMLQE		KIEEMAEQER
FLLHQETLPE		QLLAEKQLNL		SAMPVLTAPQ		LIGLYICEEN		RRANEYDFKK
ALDLLEYIDE		EEDININDLK		LEILCKALQR		DNWSSSDGKD		DPIEVSKDSI
FVKILQKLLK		DGIQLSEYLP		EVKDLLQADQ		LGSLKSNPYF		EFVLKANYEY
YVQGQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у ядрі, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Berke I.C., Boehmer T., Blobel G., Schwartz T.U. (2004). Structural and functional analysis of Nup133 domains reveals modular building blocks of the nuclear pore complex. J. Cell Biol. 167: 591—597. PMID 15557116 DOI:10.1083/jcb.200408109

Див. також

• Хромосома 1