NUP188

NUP188
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IJO
Ідентифікатори
Символи	NUP188, KIAA0169, hNup188, nucleoporin 188kDa, nucleoporin 188, SANDSTEF
Зовнішні ІД	OMIM: 615587 MGI: 2446190 HomoloGene: 45683 GeneCards: NUP188
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • ядерна пора • клітинне ядро • nuclear pore inner ring • nuclear envelope • мембрана • host cell Біологічний процес • mitotic nuclear membrane disassembly • viral transcription • protein import into nucleus • GO:0022415 viral process • RNA export from nucleus • protein sumoylation • protein transport • mRNA transport • regulation of cellular response to heat • GO:0046795 intracellular transport of virus • glomerular visceral epithelial cell migration • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23511	227699
Ensembl	ENSG00000095319	ENSMUSG00000052533
UniProt	Q5SRE5	Q6ZQH8
RefSeq (мРНК)	NM_015354	NM_198304
RefSeq (білок)	NP_056169	NP_938046
Локус (UCSC)	Хр. 9: 128.95 – 129.01 Mb	Хр. 2: 30.18 – 30.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP188 (англ. Nucleoporin 188) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 749 амінокислот, а молекулярна маса — 196 043.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAGGPCV		RSSRELWTIL		LGRSALRELS		QIEAELNKHW		RRLLEGLSYY
KPPSPSSAEK		VKANKDVASP		LKELGLRISK		FLGLDEEQSV		QLLQCYLQED
YRGTRDSVKT		VLQDERQSQA		LILKIADYYY		EERTCILRCV		LHLLTYFQDE
RHPYRVEYAD		CVDKLEKELV		SKYRQQFEEL		YKTEAPTWET		HGNLMTERQV
SRWFVQCLRE		QSMLLEIIFL		YYAYFEMAPS		DLLVLTKMFK		EQGFGSRQTN
RHLVDETMDP		FVDRIGYFSA		LILVEGMDIE		SLHKCALDDR		RELHQFAQDG
LICQDMDCLM		LTFGDIPHHA		PVLLAWALLR		HTLNPEETSS		VVRKIGGTAI
QLNVFQYLTR		LLQSLASGGN		DCTTSTACMC		VYGLLSFVLT		SLELHTLGNQ
QDIIDTACEV		LADPSLPELF		WGTEPTSGLG		IILDSVCGMF		PHLLSPLLQL
LRALVSGKST		AKKVYSFLDK		MSFYNELYKH		KPHDVISHED		GTLWRRQTPK
LLYPLGGQTN		LRIPQGTVGQ		VMLDDRAYLV		RWEYSYSSWT		LFTCEIEMLL
HVVSTADVIQ		HCQRVKPIID		LVHKVISTDL		SIADCLLPIT		SRIYMLLQRL
TTVISPPVDV		IASCVNCLTV		LAARNPAKVW		TDLRHTGFLP		FVAHPVSSLS
QMISAEGMNA		GGYGNLLMNS		EQPQGEYGVT		IAFLRLITTL		VKGQLGSTQS
QGLVPCVMFV		LKEMLPSYHK		WRYNSHGVRE		QIGCLILELI		HAILNLCHET
DLHSSHTPSL		QFLCICSLAY		TEAGQTVINI		MGIGVDTIDM		VMAAQPRSDG
AEGQGQGQLL		IKTVKLAFSV		TNNVIRLKPP		SNVVSPLEQA		LSQHGAHGNN
LIAVLAKYIY		HKHDPALPRL		AIQLLKRLAT		VAPMSVYACL		GNDAAAIRDA
FLTRLQSKIE		DMRIKVMILE		FLTVAVETQP		GLIELFLNLE		VKDGSDGSKE
FSLGMWSCLH		AVLELIDSQQ		QDRYWCPPLL		HRAAIAFLHA		LWQDRRDSAM
LVLRTKPKFW		ENLTSPLFGT		LSPPSETSEP		SILETCALIM		KIICLEIYYV
VKGSLDQSLK		DTLKKFSIEK		RFAYWSGYVK		SLAVHVAETE		GSSCTSLLEY
QMLVSAWRML		LIIATTHADI		MHLTDSVVRR		QLFLDVLDGT		KALLLVPASV
NCLRLGSMKC		TLLLILLRQW		KRELGSVDEI		LGPLTEILEG		VLQADQQLME
KTKAKVFSAF		ITVLQMKEMK		VSDIPQYSQL		VLNVCETLQE		EVIALFDQTR
HSLALGSATE		DKDSMETDDC		SRSRHRDQRD		GVCVLGLHLA		KELCEVDEDG
DSWLQVTRRL		PILPTLLTTL		EVSLRMKQNL		HFTEATLHLL		LTLARTQQGA
TAVAGAGITQ		SICLPLLSVY		QLSTNGTAQT		PSASRKSLDA		PSWPGVYRLS
MSLMEQLLKT		LRYNFLPEAL		DFVGVHQERT		LQCLNAVRTV		QSLACLEEAD
HTVGFILQLS		NFMKEWHFHL		PQLMRDIQVN		LGYLCQACTS		LLHSRKMLQH
YLQNKNGDGL		PSAVAQRVQR		PPSAASAAPS		SSKQPAADTE		ASEQQALHTV
QYGLLKILSK		TLAALRHFTP		DVCQILLDQS		LDLAEYNFLF		ALSFTTPTFD
SEVAPSFGTL		LATVNVALNM		LGELDKKKEP		LTQAVGLSTQ		AEGTRTLKSL
LMFTMENCFY		LLISQAMRYL		RDPAVHPRDK		QRMKQELSSE		LSTLLSSLSR
YFRRGAPSSP		ATGVLPSPQG		KSTSLSKASP		ESQEPLIQLV		QAFVRHMQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Miller B.R., Powers M., Park M., Fischer W., Forbes D.J. (2000). Identification of a new vertebrate nucleoporin, Nup188, with the use of a novel organelle trap assay. Mol. Biol. Cell. 11: 3381—3396. PMID 11029043 DOI:10.1091/mbc.11.10.3381
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 9