NUP43

NUP43
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4I79, 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	NUP43, bA350J20.1, p42, nucleoporin 43kDa, nucleoporin 43
Зовнішні ІД	OMIM: 608141 MGI: 1917162 HomoloGene: 11639 GeneCards: NUP43
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • nuclear envelope • ядерна пора • хромосома • центромера • клітинне ядро • кінетохор • nuclear pore outer ring • host cell Біологічний процес • mRNA transport • chromosome segregation • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	348995	69912
Ensembl	ENSG00000120253	ENSMUSG00000040034
UniProt	Q8NFH3	P59235
RefSeq (мРНК)	NM_024647 NM_198887	NM_145706
RefSeq (білок)	NP_942590	NP_663752
Локус (UCSC)	Хр. 6: 149.72 – 149.75 Mb	Хр. 10: 7.54 – 7.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP43 (англ. Nucleoporin 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 151.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEIYAKFVS		QKISKTRWRP		LPPGSLQTAE		TFATGSWDNE		ENYISLWSIG
DFGNLDSDGG		FEGDHQLLCD		IRHHGDVMDL		QFFDQERIVA		ASSTGCVTVF
LHHPNNQTLS		VNQQWTTAHY		HTGPGSPSYS		SAPCTGVVCN		NPEIVTVGED
GRINLFRADH		KEAVRTIDNA		DSSTLHAVTF		LRTPEILTVN		SIGQLKIWDF
RQQGNEPSQI		LSLTGDRVPL		HCVDRHPNQQ		HVVATGGQDG		MLSIWDVRQG
TMPVSLLKAH		EAEMWEVHFH		PSNPEHLFTC		SEDGSLWHWD		ASTDVPEKSS
LFHQGGRSST		FLSHSISNQA		NVHQSVISSW		LSTDPAKDRI		EITSLLPSRS
LSVNTLDVLG		PCLVCGTDAE		AIYVTRHLFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6