NUP50

NUP50
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EC1, 3TJ3
Ідентифікатори
Символи	NUP50, NPAP60, NPAP60L, nucleoporin 50kDa, nucleoporin 50
Зовнішні ІД	OMIM: 604646 MGI: 1351502 HomoloGene: 5190 GeneCards: NUP50
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • ядерна мембрана • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • ядерна пора • цитоплазма • центросома • host cell Біологічний процес • mRNA transport • intracellular transport • protein transport • GO:0022415 viral process • protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10762	18141
Ensembl	ENSG00000093000	ENSMUSG00000016619
UniProt	Q9UKX7	Q9JIH2
RefSeq (мРНК)	NM_007172 NM_153645 NM_153684	NM_016714
RefSeq (білок)	NP_009103 NP_705931	NP_057923
Локус (UCSC)	Хр. 22: 45.16 – 45.19 Mb	Хр. 15: 84.81 – 84.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP50 (англ. Nucleoporin 50) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 50 144.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKRNAEKEL		TDRNWDQEDE		AEEVGTFSMA		SEEVLKNRAI		KKAKRRNVGF
ESDTGGAFKG		FKGLVVPSGG		GRFSGFGSGA		GGKPLEGLSN		GNNITSAPPF
ASAKAAADPK		VAFGSLAANG		PTTLVDKVSN		PKTNGDSQQP		SSSGLASSKA
CVGNAYHKQL		AALNCSVRDW		IVKHVNTNPL		CDLTPIFKDY		EKYLANIEQQ
HGNSGRNSES		ESNKVAAETQ		SPSLFGSTKL		QQESTFLFHG		NKTEDTPDKK
MEVASEKKTD		PSSLGATSAS		FNFGKKVDSS		VLGSLSSVPL		TGFSFSPGNS
SLFGKDTTQS		KPVSSPFPTK		PLEGQAEGDS		GECKGGDEEE		NDEPPKVVVT
EVKEEDAFYS		KKCKLFYKKD		NEFKEKGIGT		LHLKPTANQK		TQLLVRADTN
LGNILLNVLI		PPNMPCTRTG		KNNVLIVCVP		NPPIDEKNAT		MPVTMLIRVK
TSEDADELHK		ILLEKKDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Trichet V., Shkolny D., Dunham I., Beare D., McDermid H.E. (1999). Mapping and complex expression pattern of the human NPAP60L nucleoporin gene. Cytogenet. Cell Genet. 85: 221—226. PMID 10449902

Див. також

• Хромосома 22