NUP88

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
NUP88
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NUP88, nucleoporin 88, FADS4
Зовнішні ІД OMIM: 602552 MGI: 104900 HomoloGene: 1901 GeneCards: NUP88
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002532
NM_001320653
NM_001083331
NM_001276406
NM_172394
RefSeq (білок)
NP_001307582
NP_002523
NP_001076800
NP_001263335
NP_765982
Локус (UCSC) Хр. 17: 5.36 – 5.42 Mb Хр. 11: 70.83 – 70.86 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NUP88 (англ. Nucleoporin 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 83 542[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAEGPVGDGELWQTWLPNHVVFLRLREGLKNQSPTEAEKPASSSLPSS
PPPQLLTRNVVFGLGGELFLWDGEDSSFLVVRLRGPSGGGEEPALSQYQR
LLCINPPLFEIYQVLLSPTQHHVALIGIKGLMVLELPKRWGKNSEFEGGK
STVNCSTTPVAERFFTSSTSLTLKHAAWYPSEILDPHVVLLTSDNVIRIY
SLREPQTPTNVIILSEAEEESLVLNKGRAYTASLGETAVAFDFGPLAAVP
KTLFGQNGKDEVVAYPLYILYENGETFLTYISLLHSPGNIGKLLGPLPMH
PAAEDNYGYDACAVLCLPCVPNILVIATESGMLYHCVVLEGEEEDDHTSE
KSWDSRIDLIPSLYVFECVELELALKLASGEDDPFDSDFSCPVKLHRDPK
CPSRYHCTHEAGVHSVGLTWIHKLHKFLGSDEEDKDSLQELSTEQKCFVE
HILCTKPLPCRQPAPIRGFWIVPDILGPTMICITSTYECLIWPLLSTVHP
ASPPLLCTREDVEVAESPLRVLAETPDSFEKHIRSILQRSVANPAFLKAS
EKDIAPPPEECLQLLSRATQVFREQYILKQDLAKEEIQRRVKLLCDQKKK
QLEDLSYCREERKSLREMAERLADKYEEAKEKQEDIMNRMKKLLHSFHSE
LPVLSDSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQQKMEKVLSLP
KPTIILSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Nucleoporin 88 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8067 (англ.) . Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, Q99567 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]