OTUB1

OTUB1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZFY, 3VON, 4DDG, 4DDI, 4DHZ, 4I6L, 4LDT
Ідентифікатори
Символи	OTUB1, OTB1, OTU1, HSPC263, OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608337 HomoloGene: 134542 GeneCards: OTUB1
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • NEDD8-specific protease activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • адаптивна імунна відповідь • protein K48-linked deubiquitination • процес імунної системи • протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of double-strand break repair • negative regulation of histone H2A K63-linked ubiquitination • cellular response to interleukin-1 • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55611	314660
Ensembl	ENSG00000167770	ENSRNOG00000009072
UniProt	Q96FW1	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_017670	XM_039080063
RefSeq (білок)	NP_060140	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 63.99 – 64 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUB1 (англ. OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 271 амінокислот, а молекулярна маса — 31 284.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEEPQQQK		QEPLGSDSEG		VNCLAYDEAI		MAQQDRIQQE		IAVQNPLVSE
RLELSVLYKE		YAEDDNIYQQ		KIKDLHKKYS		YIRKTRPDGN		CFYRAFGFSH
LEALLDDSKE		LQRFKAVSAK		SKEDLVSQGF		TEFTIEDFHN		TFMDLIEQVE
KQTSVADLLA		SFNDQSTSDY		LVVYLRLLTS		GYLQRESKFF		EHFIEGGRTV
KEFCQQEVEP		MCKESDHIHI		IALAQALSVS		IQVEYMDRGE		GGTTNPHIFP
EGSEPKVYLL		YRPGHYDILY		K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Balakirev M.Y., Tcherniuk S.O., Jaquinod M., Chroboczek J. (2003). Otubains: a new family of cysteine proteases in the ubiquitin pathway. EMBO Rep. 4: 517—522. PMID 12704427 DOI:10.1038/sj.embor.embor824
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stanisic V., Malovannaya A., Qin J., Lonard D.M., O'Malley B.W. (2009). OTU Domain-containing ubiquitin aldehyde-binding protein 1 (OTUB1) deubiquitinates estrogen receptor (ER) alpha and affects ERalpha transcriptional activity. J. Biol. Chem. 284: 16135—16145. PMID 19383985 DOI:10.1074/jbc.M109.007484
• Wiener R., Zhang X., Wang T., Wolberger C. (2012). The mechanism of OTUB1-mediated inhibition of ubiquitination. Nature. 483: 618—622. PMID 22367539 DOI:10.1038/nature10911

Див. також

• Хромосома 11