OTUD7B

OTUD7B
Ідентифікатори
Символи	OTUD7B, CEZANNE, ZA20D1, OTU deubiquitinase 7B
Зовнішні ІД	OMIM: 611748 MGI: 2654703 HomoloGene: 10624 GeneCards: OTUD7B
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • mucosal immune response • negative regulation of protein localization to nucleus • protein K48-linked deubiquitination • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process • процес імунної системи • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • протеоліз • negative regulation of interleukin-8 production • protein K63-linked deubiquitination • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • protein deubiquitination • protein K11-linked deubiquitination • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56957	229603
Ensembl	ENSG00000264522	ENSMUSG00000038495
UniProt	Q6GQQ9	B2RUR8
RefSeq (мРНК)	NM_020205	NM_001025613 NM_001025614
RefSeq (білок)	NP_064590	NP_001020784 NP_001020785
Локус (UCSC)	Хр. 1: 149.94 – 150.01 Mb	Хр. 3: 96.01 – 96.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUD7B (англ. OTU deubiquitinase 7B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 843 амінокислот, а молекулярна маса — 92 526.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTLDMDAVLS		DFVRSTGAEP		GLARDLLEGK		NWDVNAALSD		FEQLRQVHAG
NLPPSFSEGS		GGSRTPEKGF		SDREPTRPPR		PILQRQDDIV		QEKRLSRGIS
HASSSIVSLA		RSHVSSNGGG		GGSNEHPLEM		PICAFQLPDL		TVYNEDFRSF
IERDLIEQSM		LVALEQAGRL		NWWVSVDPTS		QRLLPLATTG		DGNCLLHAAS
LGMWGFHDRD		LMLRKALYAL		MEKGVEKEAL		KRRWRWQQTQ		QNKESGLVYT
EDEWQKEWNE		LIKLASSEPR		MHLGTNGANC		GGVESSEEPV		YESLEEFHVF
VLAHVLRRPI		VVVADTMLRD		SGGEAFAPIP		FGGIYLPLEV		PASQCHRSPL
VLAYDQAHFS		ALVSMEQKEN		TKEQAVIPLT		DSEYKLLPLH		FAVDPGKGWE
WGKDDSDNVR		LASVILSLEV		KLHLLHSYMN		VKWIPLSSDA		QAPLAQPESP
TASAGDEPRS		TPESGDSDKE		SVGSSSTSNE		GGRRKEKSKR		DREKDKKRAD
SVANKLGSFG		KTLGSKLKKN		MGGLMHSKGS		KPGGVGTGLG		GSSGTETLEK
KKKNSLKSWK		GGKEEAAGDG		PVSEKPPAES		VGNGGSKYSQ		EVMQSLSILR
TAMQGEGKFI		FVGTLKMGHR		HQYQEEMIQR		YLSDAEERFL		AEQKQKEAER
KIMNGGIGGG		PPPAKKPEPD		AREEQPTGPP		AESRAMAFST		GYPGDFTIPR
PSGGGVHCQE		PRRQLAGGPC		VGGLPPYATF		PRQCPPGRPY		PHQDSIPSLE
PGSHSKDGLH		RGALLPPPYR		VADSYSNGYR		EPPEPDGWAG		GLRGLPPTQT
KCKQPNCSFY		GHPETNNFCS		CCYREELRRR		EREPDGELLV		HRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Bremm A., Freund S.M., Komander D. (2010). Lys11-linked ubiquitin chains adopt compact conformations and are preferentially hydrolyzed by the deubiquitinase Cezanne. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 939—947. PMID 20622874 DOI:10.1038/nsmb.1873
• Garcia-Santisteban I., Banuelos S., Rodriguez J.A. (2012). A global survey of CRM1-dependent nuclear export sequences in the human deubiquitinase family. Biochem. J. 441: 209—217. PMID 21888622 DOI:10.1042/BJ20111300

Див. також

• Хромосома 1