PAN3

PAN3
Ідентифікатори
Символи	PAN3, PAN3 poly(A) specific ribonuclease subunit, poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3
Зовнішні ІД	OMIM: 617448 MGI: 1919837 HomoloGene: 6372 GeneCards: PAN3
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • protein kinase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • PAN complex • P-body Біологічний процес • protein phosphorylation • сортування білків • mRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	255967	72587
Ensembl	ENSG00000152520	ENSMUSG00000029647
UniProt	Q58A45	Q640Q5
RefSeq (мРНК)	NM_175854	NM_028291 NM_001359433
RefSeq (білок)	NP_787050	NP_082567 NP_001346362
Локус (UCSC)	Хр. 13: 28.14 – 28.3 Mb	Хр. 5: 147.37 – 147.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PAN3 (англ. PAN3 poly(A) specific ribonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 887 амінокислот, а молекулярна маса — 95 613.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSGGGLPPP		SAAASPSSSS		LAAAVAVVAP		PGVGGVPGGA		AVGVKLKYCR
YYAKDKTCFY		GEECQFLHED		PAAGAAPGLG		LHSNSVPLAL		AGAPVAGFPP
GAVAGGGAGP		PPGPKKPDLG		DPGTGAAAGG		GGSSGGLDGP		RLAIPGMDGG
ALTDTSLTDS		YFSTSFIGVN		GFGSPVETKY		PLMQRMTNSS		SSPSLLNDSA
KPYSAHDPLT		SPASSLFNDF		GALNISQRRK		PRKYRLGMLE		ERLVPMGSKA
RKAKNPIGCL		ADRCKSGVPI		NMVWWNRVTE		NNLQTPNPTA		SEFIPKGGST
SRLSNVSQSN		MSAFSQVFSH		PSMGSPATAG		LAPGMSLSAG		SSPLHSPKIT
PHTSPAPRRR		SHTPNPASYM		VPSSASTSVN		NPVSQTPSSG		QVIQKETVGG
TTYFYTDTTP		APLTGMVFPN		YHIYPPTAPH		VAYMQPKANA		PSFFMADELR
QELINRHLIT		MAQIDQADMP		AVPTEVDSYH		SLFPLEPLPP		PNRIQKSSNF
GYITSCYKAV		NSKDDLPYCL		RRIHGFRLVN		TKCMVLVDMW		KKIQHSNIVT
LREVFTTKAF		AEPSLVFAYD		FHAGGETMMS		RHFNDPNADA		YFTKRKWGQH
EGPLPRQHAG		LLPESLIWAY		IVQLSSALRT		IHTAGLACRV		MDPTKILITG
KTRLRVNCVG		VFDVLTFDNS		QNNNPLALMA		QYQQADLISL		GKVVLALACN
SLAGIQRENL		QKAMELVTIN		YSSDLKNLIL		YLLTDQNRMR		SVNDIMPMIG
ARFYTQLDAA		QMRNDVIEED		LAKEVQNGRL		FRLLAKLGTI		NERPEFQKDP
TWSETGDRYL		LKLFRDHLFH		QVTEAGAPWI		DLSHIISCLN		KLDAGVPEKI
SLISRDEKSV		LVVTYSDLKR		CFENTFQELI		AAANGQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Uchida N., Hoshino S., Katada T. (2004). Identification of a human cytoplasmic poly(A) nuclease complex stimulated by poly(A)-binding protein. J. Biol. Chem. 279: 1383—1391. PMID 14583602 DOI:10.1074/jbc.M309125200
• Braun J.E., Huntzinger E., Fauser M., Izaurralde E. (2011). GW182 proteins directly recruit cytoplasmic deadenylase complexes to miRNA targets. Mol. Cell. 44: 120—133. PMID 21981923 DOI:10.1016/j.molcel.2011.09.007
• Christie M., Boland A., Huntzinger E., Weichenrieder O., Izaurralde E. (2013). Structure of the PAN3 pseudokinase reveals the basis for interactions with the PAN2 deadenylase and the GW182 proteins. Mol. Cell. 51: 360—373. PMID 23932717 DOI:10.1016/j.molcel.2013.07.011

Див. також

• Хромосома 13