PARG

PARG
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4B1J, 5A7R, 4A0D, 4B1I, 4B1H, 4B1G
Ідентифікатори
Символи	PARG, PARG99, poly(ADP-ribose) glycohydrolase
Зовнішні ІД	OMIM: 603501 MGI: 1347094 HomoloGene: 50532 GeneCards: PARG
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity; • poly(ADP-ribose) glycohydrolase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• мітохондріальний матрикс; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• ATP generation from poly-ADP-D-ribose; • carbohydrate metabolic process; • regulation of DNA repair; • nucleotide-sugar metabolic process; • cellular response to DNA damage stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8505
	26430
	ENSG00000227345
	ENSMUSG00000021911
	Q86W56
	O88622
	NM_001303486; NM_001303487; NM_001303489; NM_003631; NM_001324381
	NM_011960; NM_001359915; NM_001374221
	NP_001290415; NP_001290416; NP_001290418; NP_001311310; NP_003622
	NP_036090; NP_001346844; NP_001361150
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PARG (англ. Poly(ADP-ribose) glycohydrolase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 976 амінокислот, а молекулярна маса — 111 110^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNAGPGCEPC	TKRPRWGAAT	TSPAASDARS	FPSRQRRVLD	PKDAHVQFRV
PPSSPACVPG	RAGQHRGSAT	SLVFKQKTIT	SWMDTKGIKT	AESESLDSKE
NNNTRIESMM	SSVQKDNFYQ	HNVEKLENVS	QLSLDKSPTE	KSTQYLNQHQ
TAAMCKWQNE	GKHTEQLLES	EPQTVTLVPE	QFSNANIDRS	PQNDDHSDTD
SEENRDNQQF	LTTVKLANAK	QTTEDEQARE	AKSHQKCSKS	CDPGEDCASC
QQDEIDVVPE	SPLSDVGSED	VGTGPKNDNK	LTRQESCLGN	SPPFEKESEP
ESPMDVDNSK	NSCQDSEADE	ETSPGFDEQE	DGSSSQTANK	PSRFQARDAD
IEFRKRYSTK	GGEVRLHFQF	EGGESRTGMN	DLNAKLPGNI	SSLNVECRNS
KQHGKKDSKI	TDHFMRLPKA	EDRRKEQWET	KHQRTERKIP	KYVPPHLSPD
KKWLGTPIEE	MRRMPRCGIR	LPLLRPSANH	TVTIRVDLLR	AGEVPKPFPT
HYKDLWDNKH	VKMPCSEQNL	YPVEDENGER	TAGSRWELIQ	TALLNKFTRP
QNLKDAILKY	NVAYSKKWDF	TALIDFWDKV	LEEAEAQHLY	QSILPDMVKI
ALCLPNICTQ	PIPLLKQKMN	HSITMSQEQI	ASLLANAFFC	TFPRRNAKMK
SEYSSYPDIN	FNRLFEGRSS	RKPEKLKTLF	CYFRRVTEKK	PTGLVTFTRQ
SLEDFPEWER	CEKPLTRLHV	TYEGTIEENG	QGMLQVDFAN	RFVGGGVTSA
GLVQEEIRFL	INPELIISRL	FTEVLDHNEC	LIITGTEQYS	EYTGYAETYR
WSRSHEDGSE	RDDWQRRCTE	IVAIDALHFR	RYLDQFVPEK	MRRELNKAYC
GFLRPGVSSE	NLSAVATGNW	GCGAFGGDAR	LKALIQILAA	AAAERDVVYF
TFGDSELMRD	IYSMHIFLTE	RKLTVGDVYK	LLLRYYNEEC	RNCSTPGPDI
KLYPFIYHAV	ESCAETADHS	GQRTGT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

Meyer R.G., Meyer-Ficca M.L., Jacobson E.L., Jacobson M.K. (2003). Human poly(ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) gene and the common promoter sequence it shares with inner mitochondrial membrane translocase 23 (TIM23). Gene. 314: 181—190. PMID 14527731 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00738-8
Meyer-Ficca M.L., Meyer R.G., Coyle D.L., Jacobson E.L., Jacobson M.K. (2004). Human poly(ADP-ribose) glycohydrolase is expressed in alternative splice variants yielding isoforms that localize to different cell compartments. Exp. Cell Res. 297: 521—532. PMID 15212953 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.03.050
Meyer R.G., Meyer-Ficca M.L., Whatcott C.J., Jacobson E.L., Jacobson M.K. (2007). Two small enzyme isoforms mediate mammalian mitochondrial poly(ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) activity. Exp. Cell Res. 313: 2920—2936. PMID 17509564 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.03.043
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Haince J.F., Ouellet M.E., McDonald D., Hendzel M.J., Poirier G.G. (2006). Dynamic relocation of poly(ADP-ribose) glycohydrolase isoforms during radiation-induced DNA damage. Biochim. Biophys. Acta. 1763: 226—237. PMID 16460818 DOI:10.1016/j.bbamcr.2005.11.015
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240