PCF11

PCF11
Ідентифікатори
Символи	PCF11, PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit, cleavage and polyadenylation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 608876 MGI: 1919579 HomoloGene: 32282 GeneCards: PCF11
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • mRNA binding Клітинна компонента • mRNA cleavage factor complex • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • мітохондрія Біологічний процес • mRNA 3'-end processing • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51585	74737
Ensembl	ENSG00000165494	ENSMUSG00000041328
UniProt	O94913	O94913
RefSeq (мРНК)	NM_015885 NM_001346413 NM_001346414 NM_001346415	NM_029078
RefSeq (білок)	NP_001333342 NP_001333343 NP_001333344 NP_056969	NP_001333342 NP_001333343 NP_001333344 NP_056969
Локус (UCSC)	Хр. 11: 83.16 – 83.19 Mb	Хр. 7: 92.29 – 92.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCF11 (англ. PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 555 амінокислот, а молекулярна маса — 173 050.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEQTPAEAG		AAGAREDACR		DYQSSLEDLT		FNSKPHINML		TILAEENLPF
AKEIVSLIEA		QTAKAPSSEK		LPVMYLMDSI		VKNVGREYLT		AFTKNLVATF
ICVFEKVDEN		TRKSLFKLRS		TWDEIFPLKK		LYALDVRVNS		LDPAWPIKPL
PPNVNTSSIH		VNPKFLNKSP		EEPSTPGTVV		SSPSISTPPI		VPDIQKNLTQ
EQLIRQQLLA		KQKQLLELQQ		KKLELELEQA		KAQLAVSLSV		QQETSNLGPG
SAPSKLHVSQ		IPPMAVKAPH		QVPVQSEKSR		PGPSLQIQDL		KGTNRDPRLN
RISQHSHGKD		QSHRKEFLMN		TLNQSDTKTS		KTIPSEKLNS		SKQEKSKSGE
KITKKELDQL		DSKSKSKSKS		PSPLKNKLSH		TKDLKNQESE		SMRLSDMNKR
DPRLKKHLQD		KTDGKDDDVK		EKRKTAEKKD		KDEHMKSSEH		RLAGSRNKII
NGIVQKQDTI		TEESEKQGTK		PGRSSTRKRS		RSRSPKSRSP		IIHSPKRRDR
RSPKRRQRSM		SPTSTPKAGK		IRQSGAKQSH		MEEFTPPSRE		DRNAKRSTKQ
DIRDPRRMKK		TEEERPQETT		NQHSTKSGTE		PKENVENWQS		SKSAKRWKSG
WEENKSLQQV		DEHSKPPHLR		HRESWSSTKG		ILSPRAPKQQ		QHRLSVDANL
QIPKELTLAS		KRELLQKTSE		RLASGEITQD		DFLVVVHQIR		QLFQYQEGVR
EEQRSPFNDR		FPLKRPRYED		SDKPFVDSPA		SRFAGLDTNQ		RLTALAEDRP
LFDGPSRPSV		ARDGPTKMIF		EGPNKLSPRI		DGPPTPASLR		FDGSPGQMGG
GGPLRFEGPQ		GQLGGGCPLR		FEGPPGPVGT		PLRFEGPIGQ		AGGGGFRFEG
SPGLRFEGSP		GGLRFEGPGG		QPVGGLRFEG		HRGQPVGGLR		FEGPHGQPVG
GLRFDNPRGQ		PVGGLRFEGG		HGPSGAAIRF		DGPHGQPGGG		IRFEGPLLQQ
GVGMRFEGPH		GQSVAGLRFE		GQHNQLGGNL		RFEGPHGQPG		VGIRFEGPLV
QQGGGMRFEG		PSVPGGGLRI		EGPLGQGGPR		FEGCHALRFD		GQPGQPSLLP
RFDGLHGQPG		PRFERTPGQP		GPQRFDGPPG		QQVQPRFDGV		PQRFDGPQHQ
QASRFDIPLG		LQGTRFDNHP		SQRLESVSFN		QTGPYNDPPG		NAFNAPSQGL
QFQRHEQIFD		SPQGPNFNGP		HGPGNQSFSN		PLNRASGHYF		DEKNLQSSQF
GNFGNIPAPM		TVGNIQASQQ		VLSGVAQPVA		FGQGQQFLPV		HPQNPGFVQN
PSGALPKAYP		DNHLSQVDVN		ELFSKLLKTG		ILKLSQTDSA		TTQVSEVTAQ
PPPEEEEDQN		EDQDVPDLTN		FTVEELKQRY		DSVINRLYTG		IQCYSCGMRF
TTSQTDVYAD		HLDWHYRQNR		TEKDVSRKVT		HRRWYYSLTD		WIEFEEIADL
EERAKSQFFE		KVHEEVVLKT		QEAAKEKEFQ		SVPAGPAGAV		ESCEICQEQF
EQYWDEEEEE		WHLKNAIRVD		GKIYHPSCYE		DYQNTSSFDC		TPSPSKTPVE
NPLNIMLNIV		KNELQEPCDS		PKVKEERIDT		PPACTEESIA		TPSEIKTEND
TVESV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, метилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 11