PCSK1

PCSK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KN6, 2KDT, 2KE3
Ідентифікатори
Символи	PCSK1, BMIQ12, NEC1, PC1, PC3, SPC3, proprotein convertase subtilisin/kexin type 1, PC1/3
Зовнішні ІД	OMIM: 162150 MGI: 97511 HomoloGene: 379 GeneCards: PCSK1
Пов'язані генетичні захворювання
obesity due to prohormone convertase 1 deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • endopeptidase activity • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • identical protein binding Клітинна компонента • secretory granule lumen • transport vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • мембрана • neuron projection Біологічний процес • peptide biosynthetic process • cell-cell signaling • peptide hormone processing • протеоліз • protein processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5122	18548
Ensembl	ENSG00000175426	ENSMUSG00000021587
UniProt	P29120	P63239
RefSeq (мРНК)	NM_001177876 NM_000439 NM_001177875	NM_013628
RefSeq (білок)	NP_000430 NP_001171346	NP_038656
Локус (UCSC)	Хр. 5: 96.39 – 96.43 Mb	Хр. 13: 75.24 – 75.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCSK1 (англ. Proprotein convertase subtilisin/kexin type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 84 152.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERRAWSLQC		TAFVLFCAWC		ALNSAKAKRQ		FVNEWAAEIP		GGPEAASAIA
EELGYDLLGQ		IGSLENHYLF		KHKNHPRRSR		RSAFHITKRL		SDDDRVIWAE
QQYEKERSKR		SALRDSALNL		FNDPMWNQQW		YLQDTRMTAA		LPKLDLHVIP
VWQKGITGKG		VVITVLDDGL		EWNHTDIYAN		YDPEASYDFN		DNDHDPFPRY
DPTNENKHGT		RCAGEIAMQA		NNHKCGVGVA		YNSKVGGIRM		LDGIVTDAIE
ASSIGFNPGH		VDIYSASWGP		NDDGKTVEGP		GRLAQKAFEY		GVKQGRQGKG
SIFVWASGNG		GRQGDNCDCD		GYTDSIYTIS		ISSASQQGLS		PWYAEKCSST
LATSYSSGDY		TDQRITSADL		HNDCTETHTG		TSASAPLAAG		IFALALEANP
NLTWRDMQHL		VVWTSEYDPL		ANNPGWKKNG		AGLMVNSRFG		FGLLNAKALV
DLADPRTWRS		VPEKKECVVK		DNDFEPRALK		ANGEVIIEIP		TRACEGQENA
IKSLEHVQFE		ATIEYSRRGD		LHVTLTSAAG		TSTVLLAERE		RDTSPNGFKN
WDFMSVHTWG		ENPIGTWTLR		ITDMSGRIQN		EGRIVNWKLI		LHGTSSQPEH
MKQPRVYTSY		NTVQNDRRGV		EKMVDPGEEQ		PTQENPKENT		LVSKSPSSSS
VGGRRDELEE		GAPSQAMLRL		LQSAFSKNSP		PKQSPKKSPS		AKLNIPYENF
YEALEKLNKP		SQLKDSEDSL		YNDYVDVFYN		TKPYKHRDDR		LLQALVDILN
EEN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазматичних везикулах.

Література

• Creemers J.W.M., Roebroek A.J.M., van de Ven W.J.M. (1992). Expression in human lung tumor cells of the proprotein processing enzyme PC1/PC3. Cloning and primary sequence of a 5 kb cDNA. FEBS Lett. 300: 82—88. PMID 1547893 DOI:10.1016/0014-5793(92)80169-H
• Seidah N.G., Hamelin J., Gaspar A.M., Day R., Chretien M. (1992). The cDNA sequence of the human pro-hormone and pro-protein convertase PC1. DNA Cell Biol. 11: 283—289. PMID 1605851 DOI:10.1089/dna.1992.11.283
• Jansen E. (1995). Neuroendocrine-specific expression of the human prohormone convertase 1 gene. Hormonal regulation of transcription through distinct cAMP response elements. J. Biol. Chem. 270: 15391—15397. PMID 7797529 DOI:10.1074/jbc.270.25.15391
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 5