PDCD11

PDCD11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI5
Ідентифікатори
Символи	PDCD11, ALG-4, ALG4, NFBP, RRP5, programmed cell death 11
Зовнішні ІД	OMIM: 612333 MGI: 1341788 HomoloGene: 74968 GeneCards: PDCD11
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • small-subunit processome • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • rRNA processing • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22984	18572
Ensembl	ENSG00000148843	ENSMUSG00000025047
UniProt	Q14690	Q6NS46
RefSeq (мРНК)	NM_014976	NM_011053 NM_028635
RefSeq (білок)	NP_055791	NP_035183
Локус (UCSC)	Хр. 10: 103.4 – 103.45 Mb	Хр. 19: 47.08 – 47.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDCD11 (англ. Programmed cell death 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 871 амінокислот, а молекулярна маса — 208 701.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANLEESFPR		GGTRKIHKPE		KAFQQSVEQD		NLFDISTEEG		STKRKKSQKG
PAKTKKLKIE		KRESSKSARE		KFEILSVESL		CEGMRILGCV		KEVNELELVI
SLPNGLQGFV		QVTEICDAYT		KKLNEQVTQE		QPLKDLLHLP		ELFSPGMLVR
CVVSSLGITD		RGKKSVKLSL		NPKNVNRVLS		AEALKPGMLL		TGTVSSLEDH
GYLVDIGVDG		TRAFLPLLKA		QEYIRQKNKG		AKLKVGQYLN		CIVEKVKGNG
GVVSLSVGHS		EVSTAIATEQ		QSWNLNNLLP		GLVVKAQVQK		VTPFGLTLNF
LTFFTGVVDF		MHLDPKKAGT		YFSNQAVRAC		ILCVHPRTRV		VHLSLRPIFL
QPGRPLTRLS		CQNLGAVLDD		VPVQGFFKKA		GATFRLKDGV		LAYARLSHLS
DSKNVFNPEA		FKPGNTHKCR		IIDYSQMDEL		ALLSLRTSII		EAQYLRYHDI
EPGAVVKGTV		LTIKSYGMLV		KVGEQMRGLV		PPMHLADILM		KNPEKKYHIG
DEVKCRVLLC		DPEAKKLMMT		LKKTLIESKL		PVITCYADAK		PGLQTHGFII
RVKDYGCIVK		FYNNVQGLVP		KHELSTEYIP		DPERVFYTGQ		VVKVVVLNCE
PSKERMLLSF		KLSSDPEPKK		EPAGHSQKKG		KAINIGQLVD		VKVLEKTKDG
LEVAVLPHNI		RAFLPTSHLS		DHVANGPLLH		HWLQAGDILH		RVLCLSQSEG
RVLLCRKPAL		VSTVEGGQDP		KNFSEIHPGM		LLIGFVKSIK		DYGVFIQFPS
GLSGLAPKAI		MSDKFVTSTS		DHFVEGQTVA		AKVTNVDEEK		QRMLLSLRLS
DCGLGDLAIT		SLLLLNQCLE		ELQGVRSLMS		NRDSVLIQTL		AEMTPGMFLD
LVVQEVLEDG		SVVFSGGPVP		DLVLKASRYH		RAGQEVESGQ		KKKVVILNVD
LLKLEVHVSL		HQDLVNRKAR		KLRKGSEHQA		IVQHLEKSFA		IASLVETGHL
AAFSLTSHLN		DTFRFDSEKL		QVGQGVSLTL		KTTEPGVTGL		LLAVEGPAAK
RTMRPTQKDS		ETVDEDEEVD		PALTVGTIKK		HTLSIGDMVT		GTVKSIKPTH
VVVTLEDGII		GCIHASHILD		DVPEGTSPTT		KLKVGKTVTA		RVIGGRDMKT
FKYLPISHPR		FVRTIPELSV		RPSELEDGHT		ALNTHSVSPM		EKIKQYQAGQ
TVTCFLKKYN		VVKKWLEVEI		APDIRGRIPL		LLTSLSFKVL		KHPDKKFRVG
QALRATVVGP		DSSKTLLCLS		LTGPHKLEEG		EVAMGRVVKV		TPNEGLTVSF
PFGKIGTVSI		FHMSDSYSET		PLEDFVPQKV		VRCYILSTAD		NVLTLSLRSS
RTNPETKSKV		EDPEINSIQD		IKEGQLLRGY		VGSIQPHGVF		FRLGPSVVGL
ARYSHVSQHS		PSKKALYNKH		LPEGKLLTAR		VLRLNHQKNL		VELSFLPGDT
GKPDVLSASL		EGQLTKQEER		KTEAEERDQK		GEKKNQKRNE		KKNQKGQEEV
EMPSKEKQQP		QKPQAQKRGG		RECRESGSEQ		ERVSKKPKKA		GLSEEDDSLV
DVYYREGKEE		AEETNVLPKE		KQTKPAEAPR		LQLSSGFAWN		VGLDSLTPAL
PPLAESSDSE		EDEKPHQATI		KKSKKERELE		KQKAEKELSR		IEEALMDPGR
QPESADDFDR		LVLSSPNSSI		LWLQYMAFHL		QATEIEKARA		VAERALKTIS
FREEQEKLNV		WVALLNLENM		YGSQESLTKV		FERAVQYNEP		LKVFLHLADI
YAKSEKFQEA		GELYNRMLKR		FRQEKAVWIK		YGAFLLRRSQ		AAASHRVLQR
ALECLPSKEH		VDVIAKFAQL		EFQLGDAERA		KAIFENTLST		YPKRTDVWSV
YIDMTIKHGS		QKDVRDIFER		VIHLSLAPKR		MKFFFKRYLD		YEKQHGTEKD
VQAVKAKALE		YVEAKSSVLE		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sweet T., Khalili K., Sawaya B.E., Amini S. (2003). Identification of a novel protein from glial cells based on its ability to interact with NF-kappaB subunits. J. Cell. Biochem. 90: 884—891. PMID 14624448 DOI:10.1002/jcb.10701
• Sweet T., Yen W., Khalili K., Amini S. (2008). Evidence for involvement of NFBP in processing of ribosomal RNA. J. Cell. Physiol. 214: 381—388. PMID 17654514 DOI:10.1002/jcp.21204
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 10