PDE2A

PDE2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Z1L, 3IBJ, 3ITM, 3ITU, 4C1I, 4D08, 4D09, 4HTX, 4HTZ, 4JIB
Ідентифікатори
Символи	PDE2A, CGS-PDE, PDE2A1, PED2A4, cGSPDE, phosphodiesterase 2A, IDDPADS
Зовнішні ІД	OMIM: 602658 MGI: 2446107 HomoloGene: 1952 GeneCards: PDE2A
Реагує на сполуку
guanosine cyclic 3',5'-phosphate, BAY 60-7550, Мілринон
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • calcium channel activity • cGMP binding • зв'язування з іоном металу • cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoric diester hydrolase activity • TPR domain binding • hydrolase activity • cGMP-stimulated cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • cAMP binding • protein homodimerization activity • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity • identical protein binding • magnesium ion binding • zinc ion binding • phosphate ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • perinuclear region of cytoplasm • presynaptic membrane • клітинне ядро • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондріальна внутрішня мембрана • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • establishment of endothelial barrier • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • positive regulation of inflammatory response • cellular response to cGMP • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • monocyte differentiation • cGMP-mediated signaling • cellular response to macrophage colony-stimulating factor stimulus • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of vascular permeability • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • cAMP-mediated signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of vascular permeability • cGMP catabolic process • cAMP catabolic process • calcium ion transmembrane transport • G protein-coupled receptor signaling pathway • negative regulation of cAMP-mediated signaling • cellular response to cAMP • cellular response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine • adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cGMP-mediated signaling • regulation of mitochondrion organization • heart valve development • ventricular septum development • aorta development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5138	207728
Ensembl	ENSG00000186642	ENSMUSG00000030653
UniProt	O00408	Q922S4
RefSeq (мРНК)	NM_001143839 NM_001146209 NM_001243784 NM_002599	NM_001008548 NM_001143848 NM_001143849 NM_001243757 NM_001243758
RefSeq (білок)	NP_001137311 NP_001139681 NP_001230713 NP_002590	NP_001008548 NP_001137320 NP_001137321 NP_001230686 NP_001230687
Локус (UCSC)	Хр. 11: 72.58 – 72.67 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE2A (англ. Phosphodiesterase 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 105 717.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQACGHSIL		CRSQQYPAAR		PAEPRGQQVF		LKPDEPPPPP		QPCADSLQDA
LLSLGSVIDI		SGLQRAVKEA		LSAVLPRVET		VYTYLLDGES		QLVCEDPPHE
LPQEGKVREA		IISQKRLGCN		GLGFSDLPGK		PLARLVAPLA		PDTQVLVMPL
ADKEAGAVAA		VILVHCGQLS		DNEEWSLQAV		EKHTLVALRR		VQVLQQRGPR
EAPRAVQNPP		EGTAEDQKGG		AAYTDRDRKI		LQLCGELYDL		DASSLQLKVL
QYLQQETRAS		RCCLLLVSED		NLQLSCKVIG		DKVLGEEVSF		PLTGCLGQVV
EDKKSIQLKD		LTSEDVQQLQ		SMLGCELQAM		LCVPVISRAT		DQVVALACAF
NKLEGDLFTD		EDEHVIQHCF		HYTSTVLTST		LAFQKEQKLK		CECQALLQVA
KNLFTHLDDV		SVLLQEIITE		ARNLSNAEIC		SVFLLDQNEL		VAKVFDGGVV
DDESYEIRIP		ADQGIAGHVA		TTGQILNIPD		AYAHPLFYRG		VDDSTGFRTR
NILCFPIKNE		NQEVIGVAEL		VNKINGPWFS		KFDEDLATAF		SIYCGISIAH
SLLYKKVNEA		QYRSHLANEM		MMYHMKVSDD		EYTKLLHDGI		QPVAAIDSNF
ASFTYTPRSL		PEDDTSMAIL		SMLQDMNFIN		NYKIDCPTLA		RFCLMVKKGY
RDPPYHNWMH		AFSVSHFCYL		LYKNLELTNY		LEDIEIFALF		ISCMCHDLDH
RGTNNSFQVA		SKSVLAALYS		SEGSVMERHH		FAQAIAILNT		HGCNIFDHFS
RKDYQRMLDL		MRDIILATDL		AHHLRIFKDL		QKMAEVGYDR		NNKQHHRLLL
CLLMTSCDLS		DQTKGWKTTR		KIAELIYKEF		FSQGDLEKAM		GNRPMEMMDR
EKAYIPELQI		SFMEHIAMPI		YKLLQDLFPK		AAELYERVAS		NREHWTKVSH
KFTIRGLPSN		NSLDFLDEEY		EVPDLDGTRA		PINGCCSLDA		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, мітохондрії.

Література

• Russwurm C., Zoidl G., Koesling D., Russwurm M. (2009). Dual acylation of PDE2A splice variant 3: targeting to synaptic membranes. J. Biol. Chem. 284: 25782—25790. PMID 19632989 DOI:10.1074/jbc.M109.017194
• Pandit J., Forman M.D., Fennell K.F., Dillman K.S., Menniti F.S. (2009). Mechanism for the allosteric regulation of phosphodiesterase 2A deduced from the X-ray structure of a near full-length construct. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 18225—18230. PMID 19828435 DOI:10.1073/pnas.0907635106
• Zhu J., Yang Q., Dai D., Huang Q. (2013). X-ray crystal structure of phosphodiesterase 2 in complex with a highly selective, nanomolar inhibitor reveals a binding-induced pocket important for selectivity. J. Am. Chem. Soc. 135: 11708—11711. PMID 23899287 DOI:10.1021/ja404449g

Див. також

• Хромосома 11