PDE9A

PDE9A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HD1, 2YY2, 3DY8, 3DYL, 3DYN, 3DYQ, 3DYS, 3JSI, 3JSW, 3K3E, 3K3H, 3N3Z, 3QI3, 3QI4, 4E90, 4G2J, 4G2L, 4GH6, 4Y86, 4Y87, 4Y8C
Ідентифікатори
Символи	PDE9A, HSPDE9A2, phosphodiesterase 9A
Зовнішні ІД	OMIM: 602973 MGI: 1277179 HomoloGene: 113565 GeneCards: PDE9A
шифр КФ	3.1.4.35
Реагує на сполуку
SCH-51866, zaprinast
Онтологія гена Молекулярна функція • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoric diester hydrolase activity • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • перикаріон • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • ruffle membrane • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • Сарколема Біологічний процес • cGMP metabolic process • cGMP-mediated signaling • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy • cGMP catabolic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5152	18585
Ensembl	ENSG00000160191	ENSMUSG00000041119
UniProt	O76083	O70628
RefSeq (мРНК)	NM_001001567 NM_001001568 NM_001001569 NM_001001570 NM_001001571 NM_001001572 NM_001001573 NM_001001574 NM_001001575 NM_001001576 NM_001001577 NM_001001578 NM_001001579 NM_001001580 NM_001001581 NM_001001582 NM_001001583 NM_001001584 NM_001001585 NM_002606 NM_001315533	NM_001163748 NM_008804
RefSeq (білок)	NP_001001567 NP_001001568 NP_001001569 NP_001001570 NP_001001571 NP_001001572 NP_001001573 NP_001001574 NP_001001575 NP_001001576 NP_001001577 NP_001001578 NP_001001579 NP_001001580 NP_001001581 NP_001001582 NP_001001583 NP_001001584 NP_001001585 NP_001302462 NP_002597	NP_001157220 NP_032830
Локус (UCSC)	Хр. 21: 42.65 – 42.78 Mb	Хр. 17: 31.39 – 31.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE9A (англ. Phosphodiesterase 9A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 68 493.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSGSSSYRP		KAIYLDIDGR		IQKVIFSKYC		NSSDIMDLFC		IATGLPRNTT
ISLLTTDDAM		VSIDPTMPAN		SERTPYKVRP		VAIKQLSAGV		EDKRTTSRGQ
SAERPLRDRR		VVGLEQPRRE		GAFESGQVEP		RPREPQGCYQ		EGQRIPPERE
ELIQSVLAQV		AEQFSRAFKI		NELKAEVANH		LAVLEKRVEL		EGLKVVEIEK
CKSDIKKMRE		ELAARSSRTN		CPCKYSFLDN		HKKLTPRRDV		PTYPKYLLSP
ETIEALRKPT		FDVWLWEPNE		MLSCLEHMYH		DLGLVRDFSI		NPVTLRRWLF
CVHDNYRNNP		FHNFRHCFCV		AQMMYSMVWL		CSLQEKFSQT		DILILMTAAI
CHDLDHPGYN		NTYQINARTE		LAVRYNDISP		LENHHCAVAF		QILAEPECNI
FSNIPPDGFK		QIRQGMITLI		LATDMARHAE		IMDSFKEKME		NFDYSNEEHM
TLLKMILIKC		CDISNEVRPM		EVAEPWVDCL		LEEYFMQSDR		EKSEGLPVAP
FMDRDKVTKA		TAQIGFIKFV		LIPMFETVTK		LFPMVEEIML		QPLWESRDRY
EELKRIDDAM		KELQKKTDSL		TSGATEKSRE		RSRDVKNSEG		DCA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

• Fisher D.A., Smith J.F., Pillar J.S., St Denis S.H., Cheng J.B. (1998). Isolation and characterization of PDE9A, a novel human cGMP-specific phosphodiesterase. J. Biol. Chem. 273: 15559—15564. PMID 9624146 DOI:10.1074/jbc.273.25.15559
• Rentero C., Monfort A., Puigdomenech P. (2003). Identification and distribution of different mRNA variants produced by differential splicing in the human phosphodiesterase 9A gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301: 686—692. PMID 12565835 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00021-4
• Wang P., Wu P., Egan R.W., Billah M.M. (2003). Identification and characterization of a new human type 9 cGMP-specific phosphodiesterase splice variant (PDE9A5). Differential tissue distribution and subcellular localization of PDE9A variants. Gene. 314: 15—27. PMID 14527714 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00733-9
• Rentero C., Puigdomenech P. (2006). Specific use of start codons and cellular localization of splice variants of human phosphodiesterase 9A gene. BMC Mol. Biol. 7: 39—39. PMID 17090334 DOI:10.1186/1471-2199-7-39
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Singh N., Patra S. (2014). Phosphodiesterase 9: insights from protein structure and role in therapeutics. Life Sci. 106: 1—11. PMID 24746902 DOI:10.1016/j.lfs.2014.04.007

Див. також

• Хромосома 21