PDK1

PDK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Q8F, 2Q8G, 2Q8H
Ідентифікатори
Символи	PDK1, entrez:5163, pyruvate dehydrogenase kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602524 MGI: 1926119 HomoloGene: 134437 GeneCards: PDK1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity Клітинна компонента • mitochondrial pyruvate dehydrogenase complex • мітохондріальний матрикс • клітинне ядро • ядерце • мітохондрія Біологічний процес • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • фосфорилювання • hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway • regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate • regulation of glucose metabolic process • glucose metabolic process • проліферація • protein phosphorylation • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5163	228026
Ensembl	ENSG00000152256	ENSMUSG00000006494
UniProt	Q15118	Q8BFP9
RefSeq (мРНК)	NM_001278549 NM_002610	NM_172665 NM_001360002
RefSeq (білок)	NP_001265478 NP_002601	NP_766253 NP_001346931
Локус (UCSC)	Хр. 2: 172.56 – 172.61 Mb	Хр. 2: 71.7 – 71.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDK1 (англ. Pyruvate dehydrogenase kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 49 244.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLARLLRGA		ALAGPGPGLR		AAGFSRSFSS		DSGSSPASER		GVPGQVDFYA
RFSPSPLSMK		QFLDFGSVNA		CEKTSFMFLR		QELPVRLANI		MKEISLLPDN
LLRTPSVQLV		QSWYIQSLQE		LLDFKDKSAE		DAKAIYDFTD		TVIRIRNRHN
DVIPTMAQGV		IEYKESFGVD		PVTSQNVQYF		LDRFYMSRIS		IRMLLNQHSL
LFGGKGKGSP		SHRKHIGSIN		PNCNVLEVIK		DGYENARRLC		DLYYINSPEL
ELEELNAKSP		GQPIQVVYVP		SHLYHMVFEL		FKNAMRATME		HHANRGVYPP
IQVHVTLGNE		DLTVKMSDRG		GGVPLRKIDR		LFNYMYSTAP		RPRVETSRAV
PLAGFGYGLP		ISRLYAQYFQ		GDLKLYSLEG		YGTDAVIYIK		ALSTDSIERL
PVYNKAAWKH		YNTNHEADDW		CVPSREPKDM		TTFRSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як вуглеводний обмін, обмін глюкози, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Gudi R., Bowker-Kinley M.M., Kedishvili N.Y., Zhao Y., Popov K.M. (1995). Diversity of the pyruvate dehydrogenase kinase gene family in humans. J. Biol. Chem. 270: 28989—28994. PMID 7499431 DOI:10.1074/jbc.270.48.28989
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kato M., Li J., Chuang J.L., Chuang D.T. (2007). Distinct structural mechanisms for inhibition of pyruvate dehydrogenase kinase isoforms by AZD7545, dichloroacetate, and radicicol. Structure. 15: 992—1004. PMID 17683942 DOI:10.1016/j.str.2007.07.001

Див. також

• Хромосома 2