PDLIM7

PDLIM7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Q3G
Ідентифікатори
Символи	PDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ and LIM domain 7
Зовнішні ІД	OMIM: 605903 MGI: 1914649 HomoloGene: 3980 GeneCards: PDLIM7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding Клітинна компонента • цитоплазма • ruffle • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • focal adhesion • actin cytoskeleton • гіалоплазма • Z disc • filamentous actin Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • actin cytoskeleton organization • осифікація • axon guidance • heart development • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9260	67399
Ensembl	ENSG00000196923	ENSMUSG00000021493
UniProt	Q9NR12	Q3TJD7
RefSeq (мРНК)	NM_005451 NM_203352 NM_203353 NM_213636	NM_001114087 NM_001114088 NM_026131
RefSeq (білок)	NP_005442 NP_976227 NP_998801	NP_001107559 NP_001107560 NP_080407
Локус (UCSC)	Хр. 5: 177.48 – 177.5 Mb	Хр. 13: 55.64 – 55.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDLIM7 (англ. PDZ and LIM domain 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 49 845.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSFKVVLEG		PAPWGFRLQG		GKDFNVPLSI		SRLTPGGKAA		QAGVAVGDWV
LSIDGENAGS		LTHIEAQNKI		RACGERLSLG		LSRAQPVQSK		PQKASAPAAD
PPRYTFAPSV		SLNKTARPFG		APPPADSAPQ		QNGQPLRPLV		PDASKQRLME
NTEDWRPRPG		TGQSRSFRIL		AHLTGTEFMQ		DPDEEHLKKS		SQVPRTEAPA
PASSTPQEPW		PGPTAPSPTS		RPPWAVDPAF		AERYAPDKTS		TVLTRHSQPA
TPTPLQSRTS		IVQAAAGGVP		GGGSNNGKTP		VCHQCHKVIR		GRYLVALGHA
YHPEEFVCSQ		CGKVLEEGGF		FEEKGAIFCP		PCYDVRYAPS		CAKCKKKITG
EIMHALKMTW		HVHCFTCAAC		KTPIRNRAFY		MEEGVPYCER		DYEKMFGTKC
HGCDFKIDAG		DRFLEALGFS		WHDTCFVCAI		CQINLEGKTF		YSKKDRPLCK
SHAFSHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як остеогенез, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Liu Y., Hair G.A., Boden S.D., Viggeswarapu M., Titus L. (2002). Overexpressed LIM mineralization proteins do not require LIM domains to induce bone. J. Bone Miner. Res. 17: 406—414. PMID 11874232 DOI:10.1359/jbmr.2002.17.3.406
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Durick K., Gill G.N., Taylor S.S. (1998). Shc and Enigma are both required for mitogenic signaling by Ret/ptc2. Mol. Cell. Biol. 18: 2298—2308. PMID 9528800 DOI:10.1128/MCB.18.4.2298
• Guy P.M., Kenny D.A., Gill G.N. (1999). The PDZ domain of the LIM protein enigma binds to beta-tropomyosin. Mol. Biol. Cell. 10: 1973—1984. PMID 10359609 DOI:10.1091/mbc.10.6.1973
• Wu R.-Y., Gill G.N. (1994). LIM domain recognition of a tyrosine-containing tight turn. J. Biol. Chem. 269: 25085—25090. PMID 7929196

Див. також

• Хромосома 5