PDS5B

PDS5B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5HDT
Ідентифікатори
Символи	PDS5B, APRIN, AS3, CG008, PDS5 cohesin associated factor B
Зовнішні ІД	OMIM: 605333 MGI: 2140945 HomoloGene: 41001 GeneCards: PDS5B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • DNA binding Клітинна компонента • хромосома • гіалоплазма • Хроматин • центромера • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • поділ клітини • клітинний цикл • проліферація • regulation of cell population proliferation • mitotic sister chromatid cohesion • negative regulation of cell population proliferation • GO:0100026 Репарація ДНК • lens development in camera-type eye • enteric nervous system development • neuroblast migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23047	100710
Ensembl	ENSG00000083642	ENSMUSG00000034021
UniProt	Q9NTI5	Q4VA53
RefSeq (мРНК)	NM_015032 NM_015928	NM_175310 NM_001346503
RefSeq (білок)	NP_055847	NP_001333432 NP_780519
Локус (UCSC)	Хр. 13: 32.59 – 32.78 Mb	Хр. 5: 150.6 – 150.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDS5B (англ. PDS5 cohesin associated factor B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 447 амінокислот, а молекулярна маса — 164 667.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHSKTRTND		GKITYPPGVK		EISDKISKEE		MVRRLKMVVK		TFMDMDQDSE
EEKELYLNLA		LHLASDFFLK		HPDKDVRLLV		ACCLADIFRI		YAPEAPYTSP
DKLKDIFMFI		TRQLKGLEDT		KSPQFNRYFY		LLENIAWVKS		YNICFELEDS
NEIFTQLYRT		LFSVINNGHN		QKVHMHMVDL		MSSIICEGDT		VSQELLDTVL
VNLVPAHKNL		NKQAYDLAKA		LLKRTAQAIE		PYITNFFNQV		LMLGKTSISD
LSEHVFDLIL		ELYNIDSHLL		LSVLPQLEFK		LKSNDNEERL		QVVKLLAKMF
GAKDSELASQ		NKPLWQCYLG		RFNDIHVPIR		LECVKFASHC		LMNHPDLAKD
LTEYLKVRSH		DPEEAIRHDV		IVSIVTAAKK		DILLVNDHLL		NFVRERTLDK
RWRVRKEAMM		GLAQIYKKYA		LQSAAGKDAA		KQIAWIKDKL		LHIYYQNSID
DRLLVERIFA		QYMVPHNLET		TERMKCLYYL		YATLDLNAVK		ALNEMWKCQN
LLRHQVKDLL		DLIKQPKTDA		SVKAIFSKVM		VITRNLPDPG		KAQDFMKKFT
QVLEDDEKIR		KQLEVLVSPT		CSCKQAEGCV		REITKKLGNP		KQPTNPFLEM
IKFLLERIAP		VHIDTESISA		LIKQVNKSID		GTADDEDEGV		PTDQAIRAGL
ELLKVLSFTH		PISFHSAETF		ESLLACLKMD		DEKVAEAALQ		IFKNTGSKIE
EDFPHIRSAL		LPVLHHKSKK		GPPRQAKYAI		HCIHAIFSSK		ETQFAQIFEP
LHKSLDPSNL		EHLITPLVTI		GHIALLAPDQ		FAAPLKSLVA		TFIVKDLLMN
DRLPGKKTTK		LWVPDEEVSP		ETMVKIQAIK		MMVRWLLGMK		NNHSKSGTST
LRLLTTILHS		DGDLTEQGKI		SKPDMSRLRL		AAGSAIVKLA		QEPCYHEIIT
LEQYQLCALA		INDECYQVRQ		VFAQKLHKGL		SRLRLPLEYM		AICALCAKDP
VKERRAHARQ		CLVKNINVRR		EYLKQHAAVS		EKLLSLLPEY		VVPYTIHLLA
HDPDYVKVQD		IEQLKDVKEC		LWFVLEILMA		KNENNSHAFI		RKMVENIKQT
KDAQGPDDAK		MNEKLYTVCD		VAMNIIMSKS		TTYSLESPKD		PVLPARFFTQ
PDKNFSNTKN		YLPPEMKSFF		TPGKPKTTNV		LGAVNKPLSS		AGKQSQTKSS
RMETVSNASS		SSNPSSPGRI		KGRLDSSEMD		HSENEDYTMS		SPLPGKKSDK
RDDSDLVRSE		LEKPRGRKKT		PVTEQEEKLG		MDDLTKLVQE		QKPKGSQRSR
KRGHTASESD		EQQWPEEKRL		KEDILENEDE		QNSPPKKGKR		GRPPKPLGGG
TPKEEPTMKT		SKKGSKKKSG		PPAPEEEEEE		ERQSGNTEQK		SKSKQHRVSR
RAQQRAESPE		SSAIESTQST		PQKGRGRPSK		TPSPSQPKKN		VRVGRSKQAA
TKENDSSEEV		DVFQGSSPVD		DIPQEETEEE		EVSTVNVRRR		SAKRERR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Geck P., Szelei J., Jimenez J., Sonnenschein C., Soto A.M. (1999). Early gene expression during androgen-induced inhibition of proliferation of prostate cancer cells: a new suppressor candidate on chromosome 13, in the BRCA2-Rb1 locus. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 68: 41—50. PMID 10215036 DOI:10.1016/S0960-0760(98)00165-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Geck P., Maffini M.V., Szelei J., Sonnenschein C., Soto A.M. (2000). Androgen-induced proliferative quiescence in prostate cancer cells: the role of AS3 as its mediator. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 10185—10190. PMID 10963680 DOI:10.1073/pnas.97.18.10185
• Losada A., Yokochi T., Hirano T. (2005). Functional contribution of Pds5 to cohesin-mediated cohesion in human cells and Xenopus egg extracts. J. Cell Sci. 118: 2133—2141. PMID 15855230 DOI:10.1242/jcs.02355
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 13