PDZD4

PDZD4
Ідентифікатори
Символи	PDZD4, LU1, PDZK4, PDZRN4L, PDZ domain containing 4, LNX5
Зовнішні ІД	OMIM: 300634 MGI: 2443483 HomoloGene: 13046 GeneCards: PDZD4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell cortex Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57595	245469
Ensembl	ENSG00000067840	ENSMUSG00000002006
UniProt	Q76G19 Q17RL8	Q9QY39
RefSeq (мРНК)	NM_032512 NM_001303512 NM_001303513 NM_001303514 NM_001303515 NM_001303516	NM_001029868 NM_001290540
RefSeq (білок)	NP_001290441 NP_001290442 NP_001290443 NP_001290444 NP_001290445 NP_115901 NP_001290441.1	NP_001025039 NP_001277469
Локус (UCSC)	Хр. X: 153.8 – 153.83 Mb	Хр. X: 72.84 – 72.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDZD4 (англ. PDZ domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 86 171.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCNMCVVQK		PEEQYKVMLQ		VNGKELSKLS		QEQTLQALRS		SKEPLVIQVL
RRSPRLRGDS		SCHDLQLVDS		GTQTDITFEH		IMALGKLRPP		TPPMVILEPP
PISHEYYDPA		EFMEGGPQEA		DRLDELEYEE		VELYKSSHRD		KLGLMVCYRT
DDEEDLGIYV		GEVNPNSIAA		KDGRIREGDR		IIQINGVDVQ		NREEAVAILS
QEENTNISLL		VARPESQLAK		RWKDSDRDDF		LDDFGSENEG		ELRARKLKSP
PAQQPGNEEE		KGAPDAGPGL		SNSQELDSGV		GRTDESTRNE		ESSEHDLLGD
EPPSSTNTPG		SLRKFGLQGD		ALQSRDFHFS		MDSLLAEGAG		LGGGDVPGLT
DEEYERYREL		LEIKCHLENG		NQLGLLFPRA		SGGNSALDVN		RNESLGHEMA
MLEEELRHLE		FKCRNILRAQ		KMQQLRERCM		KAWLLEEESL		YDLAASEPKK
HELSDISELP		EKSDKDSTSA		YNTGESCRST		PLLVEPLPES		PLRRAMAGNS
NLNRTPPGPA		VATPAKAAPP		PGSPAKFRSL		SRDPEAGRRQ		HAEERGRRNP
KTGLTLERVG		PESSPYLSRR		HRGQGQEGEH		YHSCVQLAPT		RGLEELGHGP
LSLAGGPRVG		GVAAAATEAP		RMEWKVKVRS		DGTRYVAKRP		VRDRLLKARA
LKIREERSGM		TTDDDAVSEM		KMGRYWSKEE		RKQHLIRARE		QRKRREFMMQ
SRLECLREQQ		NGDSKPELNI		IALSHRKTMK		KRNKKILDNW		ITIQEMLAHG
ARSADGKRVY		NPLLSVTTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagayama S., Iiizumi M., Katagiri T., Toguchida J., Nakamura Y. (2004). Identification of PDZK4, a novel human gene with PDZ domains, that is upregulated in synovial sarcomas. Oncogene. 23: 5551—5557. PMID 15077175 DOI:10.1038/sj.onc.1207710
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human PDZRN4L gene and mouse Pdzrn4l gene in silico. Int. J. Mol. Med. 13: 923—927. PMID 15138636

Див. також

• Хромосома X