PDZD8

PDZD8
Ідентифікатори
Символи	PDZD8, PDZK8, bA129M16.2, PDZ domain containing 8
Зовнішні ІД	OMIM: 614235 MGI: 2677270 HomoloGene: 14879 GeneCards: PDZD8
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • lipid binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • мембрана • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • integral component of membrane • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • regulation of cell morphogenesis • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0022415 viral process • cytoskeleton organization • lipid transport • mitochondrial calcium ion homeostasis • mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	118987	107368
Ensembl	ENSG00000165650	ENSMUSG00000074746
UniProt	Q8NEN9	B9EJ80
RefSeq (мРНК)	NM_173791	NM_001033222
RefSeq (білок)	NP_776152	NP_001028394
Локус (UCSC)	Хр. 10: 117.28 – 117.38 Mb	Хр. 19: 59.29 – 59.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDZD8 (англ. PDZ domain containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 154 амінокислот, а молекулярна маса — 128 563.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLLLMILAS		AVLGSFLTLL		AQFFLLYRRQ		PEPPADEAAR		AGEGFRYIKP
VPGLLLREYL		YGGGRDEEPS		GAAPEGGATP		TAAPETPAPP		TRETCYFLNA
TILFLFRELR		DTALTRRWVT		KKIKVEFEEL		LQTKTAGRLL		EGLSLRDVFL
GETVPFIKTI		RLVRPVVPSA		TGEPDGPEGE		ALPAACPEEL		AFEAEVEYNG
GFHLAIDVDL		VFGKSAYLFV		KLSRVVGRLR		LVFTRVPFTH		WFFSFVEDPL
IDFEVRSQFE		GRPMPQLTSI		IVNQLKKIIK		RKHTLPNYKI		RFKPFFPYQT
LQGFEEDEEH		IHIQQWALTE		GRLKVTLLEC		SRLLIFGSYD		REANVHCTLE
LSSSVWEEKQ		RSSIKTVELI		KGNLQSVGLT		LRLVQSTDGY		AGHVIIETVA
PNSPAAIADL		QRGDRLIAIG		GVKITSTLQV		LKLIKQAGDR		VLVYYERPVG
QSNQGAVLQD		NFGQLEENFL		SSSCQSGYEE		EAAGLTVDTE		SRELDSEFED
LASDVRAQNE		FKDEAQSLSH		SPKRVPTTLS		IKPLGAISPV		LNRKLAVGSH
PLPPKIQSKD		GNKPPPLKTS		EITDPAQVSK		PTQGSAFKPP		VPPRPQAKVP
LPSADAPNQA		EPDVLVEKPE		KVVPPPLVDK		SAEKQAKNVD		AIDDAAAPKQ
FLAKQEVAKD		VTSETSCPTK		DSSDDRQTWE		SSEILYRNKL		GKWTRTRASC
LFDIEACHRY		LNIALWCRDP		FKLGGLICLG		HVSLKLEDVA		LGCLATSNTE
YLSKLRLEAP		SPKAIVTRTA		LRNLSMQKGF		NDKFCYGDIT		IHFKYLKEGE
SDHHVVTNVE		KEKEPHLVEE		VSVLPKEEQF		VGQMGLTENK		HSFQDTQFQN
PTWCDYCKKK		VWTKAASQCM		FCAYVCHKKC		QEKCLAETSV		CGATDRRIDR
TLKNLRLEGQ		ETLLGLPPRV		DAEASKSVNK		TTGLTRHIIN		TSSRLLNLRQ
VSKTRLSEPG		TDLVEPSPKH		TPNTSDNEGS		DTEVCGPNSP		SKRGNSTGIK
LVRKEGGLDD		SVFIAVKEIG		RDLYRGLPTE		ERIQKLEFML		DKLQNEIDQE
LEHNNSLVRE		EKETTDTRKK		SLLSAALAKS		GERLQALTLL		MIHYRAGIED
IETLESLSLD		QHSKKISKYT		DDTEEDLDNE		ISQLIDSQPF		SSISDDLFGP
SESV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Henning M.S., Morham S.G., Goff S.P., Naghavi M.H. (2010). PDZD8 is a novel Gag-interacting factor that promotes retroviral infection. J. Virol. 84: 8990—8995. PMID 20573829 DOI:10.1128/JVI.00843-10

Див. також

• Хромосома 10