PES1

PES1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EP8
Ідентифікатори
Символи	PES1, PES, pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, NOP7
Зовнішні ІД	OMIM: 605819 MGI: 1890613 HomoloGene: 5984 GeneCards: PES1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • ribonucleoprotein complex binding Клітинна компонента • мембрана • PeBoW complex • хромосома • ядерце • condensed chromosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • preribosome, large subunit precursor Біологічний процес • protein localization to organelle • ribosome biogenesis • regulation of cell cycle • GO:0007576 nucleolus organization • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • проліферація • rRNA processing • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosomal large subunit biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23481	64934
Ensembl	ENSG00000100029	ENSMUSG00000020430
UniProt	O00541	Q9EQ61
RefSeq (мРНК)	NM_001243225 NM_001282327 NM_001282328 NM_014303	NM_022889
RefSeq (білок)	NP_001230154 NP_001269256 NP_001269257 NP_055118	NP_075027
Локус (UCSC)	Хр. 22: 30.58 – 30.61 Mb	Хр. 11: 3.91 – 3.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PES1 (англ. Pescadillo ribosomal biogenesis factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 588 амінокислот, а молекулярна маса — 68 003.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGLEKKKYE		RGSATNYITR		NKARKKLQLS		LADFRRLCIL		KGIYPHEPKH
KKKVNKGSTA		ARTFYLIKDI		RFLLHEPIVN		KFREYKVFVR		KLRKAYGKSE
WNTVERLKDN		KPNYKLDHII		KERYPTFIDA		LRDLDDALSM		CFLFSTFPRT
GKCHVQTIQL		CRRLTVEFMH		YIIAARALRK		VFLSIKGIYY		QAEVLGQPIV
WITPYAFSHD		HPTDVDYRVM		ATFTEFYTTL		LGFVNFRLYQ		LLNLHYPPKL
EGQAQAEAKA		GEGTYALDSE		SCMEKLAALS		ASLARVVVPA		TEEEAEVDEF
PTDGEMSAQE		EDRRKELEAQ		EKHKKLFEGL		KFFLNREVPR		EALAFIIRSF
GGEVSWDKSL		CIGATYDVTD		SRITHQIVDR		PGQQTSVIGR		CYVQPQWVFD
SVNARLLLPV		AEYFSGVQLP		PHLSPFVTEK		EGDYVPPEKL		KLLALQRGED
PGNLNESEEE		EEEDDNNEGD		GDEEGENEEE		EEDAEAGSEK		EEEARLAALE
EQRMEGKKPR		VMAGTLKLED		KQRLAQEEES		EAKRLAIMMM		KKREKYLYQK
IMFGKRRKIR		EANKLAEKRK		AHDEAVRSEK		KAKKARPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oeffinger M., Leung A., Lamond A., Tollervey D. (2002). Yeast Pescadillo is required for multiple activities during 60S ribosomal subunit synthesis. RNA. 8: 626—636. PMID 12022229 DOI:10.1017/S1355838202020022
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Oeffinger M., Leung A., Lamond A., Tollervey D. (2002). RNA. 8: 851—851. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 22