PGLYRP1

PGLYRP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YCK
Ідентифікатори
Символи	PGLYRP1, PGLYRP, PGRP, PGRP-S, PGRPS, TAG7, TNFSF3L, peptidoglycan recognition protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604963 MGI: 1345092 HomoloGene: 74539 GeneCards: PGLYRP1
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • peptidoglycan immune receptor activity • N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity • peptidoglycan binding Клітинна компонента • екзосома • extracellular region • specific granule lumen • phagocytic vesicle lumen • tertiary granule lumen • міжклітинний простір Біологічний процес • peptidoglycan catabolic process • negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response • negative regulation of interferon-gamma production • вроджений імунітет • negative regulation of inflammatory response • defense response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • detection of bacterium • процес імунної системи • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • pattern recognition receptor signaling pathway • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • positive regulation of cytolysis in other organism • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • response to bacterium • killing of cells of other organism Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8993	21946
Ensembl	ENSG00000008438	ENSMUSG00000030413
UniProt	O75594	O88593
RefSeq (мРНК)	NM_005091	NM_009402
RefSeq (білок)	NP_005082	NP_033428
Локус (UCSC)	Хр. 19: 46.02 – 46.02 Mb	Хр. 7: 18.61 – 18.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PGLYRP1 (англ. Peptidoglycan recognition protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 21 731.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRRSMLLAW		ALPSLLRLGA		AQETEDPACC		SPIVPRNEWK		ALASECAQHL
SLPLRYVVVS		HTAGSSCNTP		ASCQQQARNV		QHYHMKTLGW		CDVGYNFLIG
EDGLVYEGRG		WNFTGAHSGH		LWNPMSIGIS		FMGNYMDRVP		TPQAIRAAQG
LLACGVAQGA		LRSNYVLKGH		RDVQRTLSPG		NQLYHLIQNW		PHYRSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Секретований назовні.

Література

• Kang D., Liu G., Lundstroem A., Gelius E., Steiner H. (1998). A peptidoglycan recognition protein in innate immunity conserved from insects to humans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10078—10082. PMID 9707603 DOI:10.1073/pnas.95.17.10078
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu C., Xu Z., Gupta D., Dziarski R. (2001). Peptidoglycan recognition proteins: a novel family of four human innate immunity pattern recognition molecules. J. Biol. Chem. 276: 34686—34694. PMID 11461926 DOI:10.1074/jbc.M105566200
• Guan R., Wang Q., Sundberg E.J., Mariuzza R.A. (2005). Crystal structure of human peptidoglycan recognition protein S (PGRP-S) at 1.70 A resolution. J. Mol. Biol. 347: 683—691. PMID 15769462 DOI:10.1016/j.jmb.2005.01.070

Див. також

• Хромосома 19