PGLYRP4

PGLYRP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EAV, 2EAX
Ідентифікатори
Символи	PGLYRP4, PGLYRPIbeta, PGRP-Ibeta, PGRPIB, SBBI67, peptidoglycan recognition protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608198 MGI: 2686324 HomoloGene: 130057 GeneCards: PGLYRP4
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity • peptidoglycan immune receptor activity • peptidoglycan binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • extracellular region • внутрішньоклітинний • мембрана • GO:0009327 protein-containing complex • міжклітинний простір Біологічний процес • процес імунної системи • вроджений імунітет • defense response to bacterium • detection of bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • peptidoglycan catabolic process • pattern recognition receptor signaling pathway • positive regulation of cytolysis in other organism • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • antimicrobial humoral response • killing of cells of other organism • negative regulation of interferon-gamma production • negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57115	384997
Ensembl	ENSG00000163218	ENSMUSG00000042250
UniProt	Q96LB8	Q0VB07
RefSeq (мРНК)	NM_020393	NM_001165968 NM_207263
RefSeq (білок)	NP_065126	NP_001159440 NP_997146
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.33 – 153.35 Mb	Хр. 3: 90.63 – 90.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PGLYRP4 (англ. Peptidoglycan recognition protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 40 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLPWLLVFSA		LGIQAWGDSS		WNKTQAKQVS		EGLQYLFENI		SQLTEKGLPT
DVSTTVSRKA		WGAEAVGCSI		QLTTPVNVLV		IHHVPGLECH		DQTVCSQRLR
ELQAHHVHNN		SGCDVAYNFL		VGDDGRVYEG		VGWNIQGVHT		QGYNNISLGF
AFFGTKKGHS		PSPAALSAME		NLITYAVQKG		HLSSSYVQPL		LGKGENCLAP
RQKTSLKKAC		PGVVPRSVWG		ARETHCPRMT		LPAKYGIIIH		TAGRTCNISD
ECRLLVRDIQ		SFYIDRLKSC		DIGYNFLVGQ		DGAIYEGVGW		NVQGSSTPGY
DDIALGITFM		GTFTGIPPNA		AALEAAQDLI		QCAMVKGYLT		PNYLLVGHSD
VARTLSPGQA		LYNIISTWPH		FKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Liu C., Xu Z., Gupta D., Dziarski R. (2001). Peptidoglycan recognition proteins: a novel family of four human innate immunity pattern recognition molecules. J. Biol. Chem. 276: 34686—34694. PMID 11461926 DOI:10.1074/jbc.M105566200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1