PHAX

PHAX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XC7
Ідентифікатори
Символи	PHAX, RNUXA, phosphorylated adaptor for RNA export
Зовнішні ІД	OMIM: 604924 MGI: 1891839 HomoloGene: 10558 GeneCards: PHAX
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • toxic substance binding • RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • Тільце Кахаля • клітинне ядро • гіалоплазма • neuronal cell body • цитоплазма • центросома Біологічний процес • protein transport • snRNA export from nucleus • snRNA transcription by RNA polymerase II • nuclear export Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51808	56698
Ensembl	ENSG00000164902	ENSMUSG00000008301
UniProt	Q9H814	Q9JJT9
RefSeq (мРНК)	NM_032177	NM_001162989 NM_019996
RefSeq (білок)	NP_115553	NP_001156461 NP_064380
Локус (UCSC)	Хр. 5: 126.6 – 126.63 Mb	Хр. 18: 56.7 – 56.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHAX (англ. Phosphorylated adaptor for RNA export) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 44 403.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALEVGDMED		GQLSDSDSDM		TVAPSDRPLQ		LPKVLGGDSA		MRAFQNTATA
CAPVSHYRAV		ESVDSSEESF		SDSDDDSCLW		KRKRQKCFNP		PPKPEPFQFG
QSSQKPPVAG		GKKINNIWGA		VLQEQNQDAV		ATELGILGME		GTIDRSRQSE
TYNYLLAKKL		RKESQEHTKD		LDKELDEYMH		GGKKMGSKEE		ENGQGHLKRK
RPVKDRLGNR		PEMNYKGRYE		ITAEDSQEKV		ADEISFRLQE		PKKDLIARVV
RIIGNKKAIE		LLMETAEVEQ		NGGLFIMNGS		RRRTPGGVFL		NLLKNTPSIS
EEQIKDIFYI		ENQKEYENKK		AARKRRTQVL		GKKMKQAIKS		LNFQEDDDTS
RETFASDTNE		ALASLDESQE		GHAEAKLEAE		EAIEVDHSHD		LDIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Segref A., Mattaj I.W., Ohno M. (2001). The evolutionarily conserved region of the U snRNA export mediator PHAX is a novel RNA-binding domain that is essential for U snRNA export. RNA. 7: 351—360. PMID 11333016 DOI:10.1017/S1355838201002278
• Mourao A., Varrot A., Mackereth C.D., Cusack S., Sattler M. (2010). Structure and RNA recognition by the snRNA and snoRNA transport factor PHAX. RNA. 16: 1205—1216. PMID 20430857 DOI:10.1261/rna.2009910

Див. також

• Хромосома 5