PLSCR1

PLSCR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1Y2A
Ідентифікатори
Символи	PLSCR1, MMTRA1B, phospholipid scramblase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604170 MGI: 893575 HomoloGene: 41418 GeneCards: PLSCR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phospholipid scramblase activity; • DNA binding; • calcium ion binding; • CD4 receptor binding; • SH3 domain binding; • epidermal growth factor receptor binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • ядерце; • membrane raft; • екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• phosphatidylserine biosynthetic process; • regulation of mast cell activation; • plasma membrane phospholipid scrambling; • positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity; • response to interferon-beta; • regulation of Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway; • platelet activation; • negative regulation of viral genome replication; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • defense response to virus; • acute-phase response; • positive regulation of innate immune response; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5359
	22038
	ENSG00000188313
	ENSMUSG00000032369
	O15162
	Q9JJ00
	NM_021105; NM_001363872; NM_001363874
	NM_011636
	NP_066928; NP_001350801; NP_001350803
	NP_035766
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PLSCR1 (англ. Phospholipid scramblase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 318 амінокислот, а молекулярна маса — 35 049^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDKQNSQMNA	SHPETNLPVG	YPPQYPPTAF	QGPPGYSGYP	GPQVSYPPPP
AGHSGPGPAG	FPVPNQPVYN	QPVYNQPVGA	AGVPWMPAPQ	PPLNCPPGLE
YLSQIDQILI	HQQIELLEVL	TGFETNNKYE	IKNSFGQRVY	FAAEDTDCCT
RNCCGPSRPF	TLRIIDNMGQ	EVITLERPLR	CSSCCCPCCL	QEIEIQAPPG
VPIGYVIQTW	HPCLPKFTIQ	NEKREDVLKI	SGPCVVCSCC	GDVDFEIKSL
DEQCVVGKIS	KHWTGILREA	FTDADNFGIQ	FPLDLDVKMK	AVMIGACFLI
DFMFFESTGS	QEQKSGVW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як антивірусний захист, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Kasukabe T., Kobayashi H., Kaneko Y., Okabe-Kado J., Honma Y. (1998). Identity of human normal counterpart (MmTRA1b) of mouse leukemogenesis-associated gene (MmTRA1a) product as plasma membrane phospholipid scramblase and chromosome mapping of the human MmTRA1b/phospholipid scramblase gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 249: 449—455. PMID 9712717 DOI:10.1006/bbrc.1998.9190
Wiedmer T., Zhou Q., Kwoh D.Y., Sims P.J. (2000). Identification of three new members of the phospholipid scramblase gene family. Biochim. Biophys. Acta. 1467: 244—253. PMID 10930526 DOI:10.1016/S0005-2736(00)00236-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Basse F., Stout J.G., Sims P.J., Wiedmer T. (1996). Isolation of an erythrocyte membrane protein that mediates Ca2+-dependent transbilayer movement of phospholipid. J. Biol. Chem. 271: 17205—17210. PMID 8663431 DOI:10.1074/jbc.271.29.17205
Zhao J., Zhou Q., Wiedmer T., Sims P.J. (1998). Palmitoylation of phospholipid scramblase is required for normal function in promoting Ca2+-activated transbilayer movement of membrane phospholipids. Biochemistry. 37: 6361—6366. PMID 9572851 DOI:10.1021/bi980218m
Zhou Q., Sims P.J., Wiedmer T. (1998). Identity of a conserved motif in phospholipid scramblase that is required for Ca2+-accelerated transbilayer movement of membrane phospholipids. Biochemistry. 37: 2356—2360. PMID 9485382 DOI:10.1021/bi972625o