PNPLA7

PNPLA7
Ідентифікатори
Символи	PNPLA7, C9orf111, NTE-R1, NTEL1, patatin like phospholipase domain containing 7
Зовнішні ІД	OMIM: 612122 MGI: 2385325 HomoloGene: 62431 GeneCards: PNPLA7
Онтологія гена Молекулярна функція • lysophospholipase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • organelle membrane • integral component of membrane • lysosomal membrane • лізосома • ядерна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондріальна мембрана • клітинне ядро • мітохондрія • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • обмін речовин • lipid metabolism • lipid catabolic process • GO:0007571 розвойовий процес Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	375775	241274
Ensembl	ENSG00000130653	ENSMUSG00000036833
UniProt	Q6ZV29	A2AJ88
RefSeq (мРНК)	NM_001098537 NM_152286	NM_146251
RefSeq (білок)	NP_001092007 NP_689499	NP_666363
Локус (UCSC)	Хр. 9: 137.46 – 137.55 Mb	Хр. 2: 24.98 – 25.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PNPLA7 (англ. Patatin like phospholipase domain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 317 амінокислот, а молекулярна маса — 145 733.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEEKDDSPQ		LTGIAVGALL		ALALVGVLIL		FMFRRLRQFR		QAQPTPQYRF
RKRDKVMFYG		RKIMRKVTTL		PNTLVENTAL		PRQRARKRTK		VLSLAKRILR
FKKEYPALQP		KEPPPSLLEA		DLTEFDVKNS		HLPSEVLYML		KNVRVLGHFE
KPLFLELCKH		IVFVQLQEGE		HVFQPREPDP		SICVVQDGRL		EVCIQDTDGT
EVVVKEVLAG		DSVHSLLSIL		DIITGHAAPY		KTVSVRAAIP		STILRLPAAA
FHGVFEKYPE		TLVRVVQIIM		VRLQRVTFLA		LHNYLGLTTE		LFNAESQAIP
LVSVASVAAG		KAKKQVFYGE		EERLKKPPRL		QESCDSDHGG		GRPAAAGPLL
KRSHSVPAPS		IRKQILEELE		KPGAGDPDPS		APQGGPGSAT		SDLGMACDRA
RVFLHSDEHP		GSSVASKSRK		SVMVAEIPST		VSQHSESHTD		ETLASRKSDA
IFRAAKKDLL		TLMKLEDSSL		LDGRVALLHV		PAGTVVSRQG		DQDASILFVV
SGLLHVYQRK		IGSQEDTCLF		LTRPGEMVGQ		LAVLTGEPLI		FTVKANRDCS
FLSISKAHFY		EIMRKQPTVV		LGVAHTVVKR		MSSFVRQIDF		ALDWVEVEAG
RAIYRQGDKS		DCTYIMLSGR		LRSVIRKDDG		KKRLAGEYGR		GDLVGVVETL
THQARATTVH		AVRDSELAKL		PAGALTSIKR		RYPQVVTRLI		HLLGEKILGS
LQQGPVTGHQ		LGLPTEGSKW		DLGNPAVNLS		TVAVMPVSEE		VPLTAFALEL
EHALSAIGPT		LLLTSDNIKR		RLGSAALDSV		HEYRLSSWLG		QQEDTHRIVL
YQVDGTLTPW		TQRCVRQADC		ILIVGLGDQE		PTVGELERML		ESTAVRAQKQ
LILLHREEGP		APARTVEWLN		MRSWCSGHLH		LCCPRRVFSR		RSLPKLVEMY
KHVFQRPPDR		HSDFSRLARV		LTGNAIALVL		GGGGARGCAQ		VGVLKALAEC
GIPVDMVGGT		SIGAFVGALY		SEERNYSQMR		IRAKQWAEGM		TSLMKAALDL
TYPITSMFSG		AGFNSSIFSV		FKDQQIEDLW		IPYFAITTDI		TASAMRVHTD
GSLWWYVRAS		MSLSGYMPPL		CDPKDGHLLM		DGGYINNLPA		DVARSMGAKV
VIAIDVGSRD		ETDLTNYGDA		LSGWWLLWKR		WNPLATKVKV		LNMAEIQTRL
AYVCCVRQLE		VVKSSDYCEY		LRPPIDSYST		LDFGKFNEIC		EVGYQHGRTV
FDIWGRSGVL		EKMLRDQQGP		SKKPASAVLT		CPNASFTDLA		EIVSRIEPAK
PAMVDDESDY		QTEYEEELLD		VPRDAYADFQ		STSAQQGSDL		EDESSLRHRH
PSLAFPKLSE		GSSDQDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, деградація ліпідів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, мікросомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9