PNRC2

PNRC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4B6H
Ідентифікатори
Символи	PNRC2, proline rich nuclear receptor coactivator 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611882 MGI: 106512 HomoloGene: 9821 GeneCards: PNRC2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • P-body • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • transcription, DNA-templated • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55629	52830
Ensembl	ENSG00000189266	ENSMUSG00000028675
UniProt	Q9NPJ4	Q9CR73
RefSeq (мРНК)	NM_017761	NM_026383
RefSeq (білок)	NP_060231	NP_080659
Локус (UCSC)	Хр. 1: 23.96 – 23.96 Mb	Хр. 4: 135.6 – 135.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PNRC2 (англ. Proline rich nuclear receptor coactivator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 139 амінокислот, а молекулярна маса — 15 591.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGGERYNIP		APQSRNVSKN		QQQLNRQKTK		EQNSQMKIVH		KKKERGHGYN
SSAAAWQAMQ		NGGKNKNFPN		NQSWNSSLSG		PRLLFKSQAN		QNYAGAKFSE
PPSPSVLPKP		PSHWVPVSFN		PSDKEIMTFQ		LKTLLKVQV

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hentschke M., Borgmeyer U. (2003). Identification of PNRC2 and TLE1 as activation function-1 cofactors of the orphan nuclear receptor ERRgamma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 312: 975—982. PMID 14651967 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.025
• Cho H., Kim K.M., Kim Y.K. (2009). Human proline-rich nuclear receptor coregulatory protein 2 mediates an interaction between mRNA surveillance machinery and decapping complex. Mol. Cell. 33: 75—86. PMID 19150429 DOI:10.1016/j.molcel.2008.11.022
• Zhou D., Chen S. (2001). PNRC2 is a 16 kDa coactivator that interacts with nuclear receptors through an SH3-binding motif. Nucleic Acids Res. 29: 3939—3948. PMID 11574675

Див. також

• Хромосома 1