POGZ

POGZ
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E72, 2N3A
Ідентифікатори
Символи	POGZ, ZNF280E, ZNF635, ZNF635m, MRD37, WHSUS, pogo transposable element with ZNF domain, pogo transposable element derived with ZNF domain
Зовнішні ІД	OMIM: 614787 MGI: 2442117 HomoloGene: 9022 GeneCards: POGZ
Пов'язані генетичні захворювання
White-Sutton syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • histone methyltransferase complex Біологічний процес • kinetochore assembly • клітинний цикл • mitotic sister chromatid cohesion • поділ клітини • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23126	229584
Ensembl	ENSG00000143442	ENSMUSG00000038902
UniProt	Q7Z3K3	Q8BZH4
RefSeq (мРНК)	NM_001194937 NM_001194938 NM_015100 NM_145796 NM_207171	NM_001165948 NM_172683 NM_001368811 NM_001368812
RefSeq (білок)	NP_001181866 NP_001181867 NP_055915 NP_665739 NP_997054	NP_001159420 NP_766271 NP_001355740 NP_001355741
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.4 – 151.46 Mb	Хр. 3: 94.74 – 94.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POGZ (англ. Pogo transposable element derived with ZNF domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 410 амінокислот, а молекулярна маса — 155 344.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADTDLFMEC		EEEELEPWQK		ISDVIEDSVV		EDYNSVDKTT		TVSVSQQPVS
APVPIAAHAS		VAGHLSTSTT		VSSSGAQNSD		STKKTLVTLI		ANNNAGNPLV
QQGGQPLILT		QNPAPGLGTM		VTQPVLRPVQ		VMQNANHVTS		SPVASQPIFI
TTQGFPVRNV		RPVQNAMNQV		GIVLNVQQGQ		TVRPITLVPA		PGTQFVKPTV
GVPQVFSQMT		PVRPGSTMPV		RPTTNTFTTV		IPATLTIRST		VPQSQSQQTK
STPSTSTTPT		ATQPTSLGQL		AVQSPGQSNQ		TTNPKLAPSF		PSPPAVSIAS
FVTVKRPGVT		GENSNEVAKL		VNTLNTIPSL		GQSPGPVVVS		NNSSAHGSQR
TSGPESSMKV		TSSIPVFDLQ		DGGRKICPRC		NAQFRVTEAL		RGHMCYCCPE
MVEYQKKGKS		LDSEPSVPSA		AKPPSPEKTA		PVASTPSSTP		IPALSPPTKV
PEPNENVGDA		VQTKLIMLVD		DFYYGRDGGK		VAQLTNFPKV		ATSFRCPHCT
KRLKNNIRFM		NHMKHHVELD		QQNGEVDGHT		ICQHCYRQFS		TPFQLQCHLE
NVHSPYESTT		KCKICEWAFE		SEPLFLQHMK		DTHKPGEMPY		VCQVCQYRSS
LYSEVDVHFR		MIHEDTRHLL		CPYCLKVFKN		GNAFQQHYMR		HQKRNVYHCN
KCRLQFLFAK		DKIEHKLQHH		KTFRKPKQLE		GLKPGTKVTI		RASRGQPRTV
PVSSNDTPPS		ALQEAAPLTS		SMDPLPVFLY		PPVQRSIQKR		AVRKMSVMGR
QTCLECSFEI		PDFPNHFPTY		VHCSLCRYST		CCSRAYANHM		INNHVPRKSP
KYLALFKNSV		SGIKLACTSC		TFVTSVGDAM		AKHLVFNPSH		RSSSILPRGL
TWIAHSRHGQ		TRDRVHDRNV		KNMYPPPSFP		TNKAATVKSA		GATPAEPEEL
LTPLAPALPS		PASTATPPPT		PTHPQALALP		PLATEGAECL		NVDDQDEGSP
VTQEPELASG		GGGSGGVGKK		EQLSVKKLRV		VLFALCCNTE		QAAEHFRNPQ
RRIRRWLRRF		QASQGENLEG		KYLSFEAEEK		LAEWVLTQRE		QQLPVNEETL
FQKATKIGRS		LEGGFKISYE		WAVRFMLRHH		LTPHARRAVA		HTLPKDVAEN
AGLFIDFVQR		QIHNQDLPLS		MIVAIDEISL		FLDTEVLSSD		DRKENALQTV
GTGEPWCDVV		LAILADGTVL		PTLVFYRGQM		DQPANMPDSI		LLEAKESGYS
DDEIMELWST		RVWQKHTACQ		RSKGMLVMDC		HRTHLSEEVL		AMLSASSTLP
AVVPAGCSSK		IQPLDVCIKR		TVKNFLHKKW		KEQAREMADT		ACDSDVLLQL
VLVWLGEVLG		VIGDCPELVQ		RSFLVASVLP		GPDGNINSPT		RNADMQEELI
ASLEEQLKLS		GEHSESSTPR		PRSSPEETIE		PESLHQLFEG		ESETESFYGF
EEADLDLMEI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Large-scale discovery of novel genetic causes of developmental disorders. Nature. 519: 223—228. 2015. PMID 25533962 DOI:10.1038/nature14135

Див. також

• Хромосома 1