POLB

POLB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BPX, 1BPY, 1BPZ, 1MQ2, 1MQ3, 1TV9, 1TVA, 1ZJM, 1ZJN, 1ZQA, 1ZQB, 1ZQC, 1ZQD, 1ZQE, 1ZQF, 1ZQG, 1ZQH, 1ZQI, 1ZQJ, 1ZQK, 1ZQL, 1ZQM, 1ZQN, 1ZQO, 1ZQP, 1ZQQ, 1ZQR, 1ZQS, 1ZQT, 2FMP, 2FMQ, 2FMS, 2I9G, 2ISO, 2ISP, 2P66, 2PXI, 3C2K, 3C2L, 3C2M, 3GDX, 3ISB, 3ISC, 3ISD, 3JPN, 3JPO, 3JPP, 3JPQ, 3JPR, 3JPS, 3JPT, 3LK9, 3MBY, 3OGU, 3RH4, 3RH5, 3RH6, 3RJE, 3RJF, 3RJG, 3RJH, 3RJI, 3RJJ, 3RJK, 3TFR, 3TFS, 4DO9, 4DOA, 4DOB, 4DOC, 4F5N, 4F5O, 4F5P, 4F5Q, 4F5R, 4GXI, 4GXJ, 4GXK, 4JWM, 4JWN, 4KLD, 4KLE, 4KLF, 4KLG, 4KLH, 4KLI, 4KLJ, 4KLL, 4KLM, 4KLO, 4KLQ, 4KLS, 4KLT, 4KLU, 4LVS, 4M2Y, 4M47, 4M9G, 4M9H, 4M9J, 4M9L, 4M9N, 4MF2, 4MF8, 4MFA, 4MFC, 4MFF, 4NLK, 4NLN, 4NLZ, 4NM1, 4NM2, 4NXZ, 4NY8, 4O5C, 4O5E, 4O5K, 4O9M, 4P2H, 4PGQ, 4PGX, 4PGY, 4PH5, 4PHA, 4PHD, 4PHE, 4PHP, 4PPX, 4R63, 4R64, 4R65, 4R66, 4RPX, 4RPY, 4RPZ, 4RQ0, 4RQ1, 4RQ2, 4RQ3, 4RQ4, 4RQ5, 4RQ6, 4RQ7, 4RQ8, 4RT2, 4RT3, 4TUP, 4TUQ, 4TUR, 4TUS, 4UAW, 4UAY, 4UAZ, 4UB1, 4UB2, 4UB3, 4UB4, 4UB5, 4UBB, 4UBC, 7ICE, 7ICF, 7ICG, 7ICH, 7ICI, 7ICJ, 7ICK, 7ICL, 7ICM, 7ICN, 7ICO, 7ICP, 7ICQ, 7ICR, 7ICS, 7ICT, 7ICU, 7ICV, 8ICA, 8ICB, 8ICC, 8ICE, 8ICF, 8ICG, 8ICH, 8ICI, 8ICJ, 8ICK, 8ICL, 8ICM, 8ICN, 8ICO, 8ICP, 8ICQ, 8ICR, 8ICS, 8ICT, 8ICU, 8ICV, 8ICW, 8ICX, 8ICY, 8ICZ, 9ICA, 9ICB, 9ICC, 9ICE, 9ICF, 9ICG, 9ICH, 9ICI, 9ICJ, 9ICK, 9ICL, 9ICM, 9ICN, 9ICO, 9ICP, 9ICQ, 9ICR, 9ICS, 9ICT, 9ICU, 9ICV, 9ICW, 9ICX, 9ICY, 5BOL, 5BOM, 5BPC, 5DB8, 5DBB, 5DBA, 5DB7, 5DBC, 5DB9, 5DB6, 4YMN, 4YN4, 4YMO, 4YMM, 4Z6C, 4Z6F, 4Z6D, 4Z6E
Ідентифікатори
Символи	POLB, DNA polymerase beta
Зовнішні ІД	OMIM: 174760 MGI: 97740 HomoloGene: 2013 GeneCards: POLB
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • microtubule binding • зв'язування з іоном металу • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • enzyme binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • ДНК-полімераза • DNA polymerase activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • spindle microtubule • мікротрубочка • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • neuron apoptotic process • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • pyrimidine dimer repair • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA-dependent DNA replication • DNA biosynthetic process • homeostasis of number of cells • response to hyperoxia • GO:0010260 старіння людини • spleen development • salivary gland morphogenesis • cellular response to DNA damage stimulus • immunoglobulin heavy chain V-D-J recombination • реплікація ДНК • somatic diversification of immunoglobulins • base-excision repair, gap-filling • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • response to ethanol • inflammatory response • lymph node development • response to gamma radiation • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0097285 апоптоз • base-excision repair • base-excision repair, DNA ligation • protein deubiquitination • double-strand break repair via nonhomologous end joining Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5423	18970
Ensembl	ENSG00000070501	ENSMUSG00000031536
UniProt	P06746	Q8K409
RefSeq (мРНК)	NM_002690	NM_011130
RefSeq (білок)	NP_002681	NP_035260
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 8: 23.12 – 23.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLB (англ. DNA polymerase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 38 178.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKRKAPQET		LNGGITDMLT		ELANFEKNVS		QAIHKYNAYR		KAASVIAKYP
HKIKSGAEAK		KLPGVGTKIA		EKIDEFLATG		KLRKLEKIRQ		DDTSSSINFL
TRVSGIGPSA		ARKFVDEGIK		TLEDLRKNED		KLNHHQRIGL		KYFGDFEKRI
PREEMLQMQD		IVLNEVKKVD		SEYIATVCGS		FRRGAESSGD		MDVLLTHPSF
TSESTKQPKL		LHQVVEQLQK		VHFITDTLSK		GETKFMGVCQ		LPSKNDEKEY
PHRRIDIRLI		PKDQYYCGVL		YFTGSDIFNK		NMRAHALEKG		FTINEYTIRP
LGVTGVAGEP		LPVDSEKDIF		DYIQWKYREP		KDRSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном натрію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bennett R.A., Wilson D.M. III, Wong D., Demple B. (1997). Interaction of human apurinic endonuclease and DNA polymerase beta in the base excision repair pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 7166—7169. PMID 9207062 DOI:10.1073/pnas.94.14.7166
• Matsumoto Y., Kim K., Katz D.S., Feng J.-A. (1998). Catalytic center of DNA polymerase beta for excision of deoxyribose phosphate groups. Biochemistry. 37: 6456—6464. PMID 9572863 DOI:10.1021/bi9727545
• Pelletier H., Sawaya M.R., Wolfle W., Wilson S.H., Kraut J. (1996). A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta. Biochemistry. 35: 12762—12777. PMID 8841119 DOI:10.1021/bi9529566
• Pelletier H., Sawaya M.R. (1996). Characterization of the metal ion binding helix-hairpin-helix motifs in human DNA polymerase beta by X-ray structural analysis. Biochemistry. 35: 12778—12787. PMID 8841120 DOI:10.1021/bi960790i
• Sawaya M.R., Prasad R., Wilson S.H., Kraut J., Pelletier H. (1997). Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with gapped and nicked DNA: evidence for an induced fit mechanism. Biochemistry. 36: 11205—11215. PMID 9287163 DOI:10.1021/bi9703812

Див. також

• Хромосома 8