POLDIP3

POLDIP3
Ідентифікатори
Символи	POLDIP3, PDIP46, SKAR, polymerase (DNA) delta interacting protein 3, DNA polymerase delta interacting protein 3, PDIP3
Зовнішні ІД	OMIM: 611520 MGI: 1921076 HomoloGene: 13007 GeneCards: POLDIP3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• exon-exon junction complex; • transcription export complex; • клітинне ядро; • nuclear speck; • цитоплазма; • гіалоплазма; • нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• poly(A)+ mRNA export from nucleus; • mRNA transport; • regulation of translation; • positive regulation of translation; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA 3'-end processing; • RNA export from nucleus; • mRNA export from nucleus; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	84271
	73826
	ENSG00000100227
	ENSMUSG00000041815
	Q9BY77; Q8WUT1
	Q8BG81
	NM_001278657; NM_032311; NM_178136; NM_001363052
	NM_178627; NM_001347082
	NP_001265586; NP_115687; NP_835237; NP_001349981
	NP_001334011; NP_848742
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLDIP3 (англ. DNA polymerase delta interacting protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 421 амінокислот, а молекулярна маса — 46 089^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADISLDELI	RKRGAAAKGR	LNARPGVGGV	RSRVGIQQGL	LSQSTRTATF
QQRFDARQKI	GLSDARLKLG	VKDAREKLLQ	KDARFRIKGK	VQDAREMLNS
RKQQTTVPQK	PRQVADAREK	ISLKRSSPAA	FINPPIGTVT	PALKLTKTIQ
VPQQKAMAPL	HPHPAGMRIN	VVNNHQAKQN	LYDLDEDDDG	IASVPTKQMK
FAASGGFLHH	MAGLSSSKLS	MSKALPLTKV	VQNDAYTAPA	LPSSIRTKAL
TNMSRTLVNK	EEPPKELPAA	EPVLSPLEGT	KMTVNNLHPR	VTEEDIVELF
CVCGALKRAR	LVHPGVAEVV	FVKKDDAITA	YKKYNNRCLD	GQPMKCNLHM
NGNVITSDQP	ILLRLSDSPS	MKKESELPRR	VNSASSSNPP	AEVDPDTILK
ALFKSSGASV	TTQPTEFKIK	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu L., Rodriguez-Belmonte E.M., Mazloum N., Xie B., Lee M.Y.W.T. (2003). Identification of a novel protein, PDIP38, that interacts with the p50 subunit of DNA polymerase delta and proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 278: 10041—10047. PMID 12522211 DOI:10.1074/jbc.M208694200
Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ma X.M., Yoon S.O., Richardson C.J., Julich K., Blenis J. (2008). SKAR links pre-mRNA splicing to mTOR/S6K1-mediated enhanced translation efficiency of spliced mRNAs. Cell. 133: 303—313. PMID 18423201 DOI:10.1016/j.cell.2008.02.031
Smyk A., Szuminska M., Uniewicz K.A., Graves L.M., Kozlowski P. (2006). Human enhancer of rudimentary is a molecular partner of PDIP46/SKAR, a protein interacting with DNA polymerase delta and S6K1 and regulating cell growth. FEBS J. 273: 4728—4741. PMID 16984396 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05477.x
Folco E.G., Lee C.S., Dufu K., Yamazaki T., Reed R. (2012). The proteins PDIP3 and ZC11A associate with the human TREX complex in an ATP-dependent manner and function in mRNA export. PLoS ONE. 7: E43804—E43804. PMID 22928037 DOI:10.1371/journal.pone.0043804