POLN

POLN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4XVI, 4XVK, 4XVL, 4XVM
Ідентифікатори
Символи	POLN, POL4P, polymerase (DNA) nu, DNA polymerase nu
Зовнішні ІД	OMIM: 610887 HomoloGene: 129696 GeneCards: POLN
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • 5'-3' exonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cyclin binding • DNA-directed DNA polymerase activity • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • реплікація ДНК • double-strand break repair via homologous recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA-dependent DNA replication • interstrand cross-link repair • translesion synthesis • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	353497	566857
Ensembl	ENSG00000130997	ENSDARG00000103961
UniProt	Q7Z5Q5	A5X572
RefSeq (мРНК)	NM_181808	NM_001100026
RefSeq (білок)	NP_861524	NP_001093496
Локус (UCSC)	Хр. 4: 2.07 – 2.24 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLN (англ. DNA polymerase nu) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 900 амінокислот, а молекулярна маса — 100 307.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENYEALVGF		DLCNTPLSSV		AQKIMSAMHS		GDLVDSKTWG		KSTETMEVIN
KSSVKYSVQL		EDRKTQSPEK		KDLKSLRSQT		SRGSAKLSPQ		SFSVRLTDQL
SADQKQKSIS		SLTLSSCLIP		QYNQEASVLQ		KKGHKRKHFL		MENINNENKG
SINLKRKHIT		YNNLSEKTSK		QMALEEDTDD		AEGYLNSGNS		GALKKHFCDI
RHLDDWAKSQ		LIEMLKQAAA		LVITVMYTDG		STQLGADQTP		VSSVRGIVVL
VKRQAEGGHG		CPDAPACGPV		LEGFVSDDPC		IYIQIEHSAI		WDQEQEAHQQ
FARNVLFQTM		KCKCPVICFN		AKDFVRIVLQ		FFGNDGSWKH		VADFIGLDPR
IAAWLIDPSD		ATPSFEDLVE		KYCEKSITVK		VNSTYGNSSR		NIVNQNVREN
LKTLYRLTMD		LCSKLKDYGL		WQLFRTLELP		LIPILAVMES		HAIQVNKEEM
EKTSALLGAR		LKELEQEAHF		VAGERFLITS		NNQLREILFG		KLKLHLLSQR
NSLPRTGLQK		YPSTSEAVLN		ALRDLHPLPK		IILEYRQVHK		IKSTFVDGLL
ACMKKGSISS		TWNQTGTVTG		RLSAKHPNIQ		GISKHPIQIT		TPKNFKGKED
KILTISPRAM		FVSSKGHTFL		AADFSQIELR		ILTHLSGDPE		LLKLFQESER
DDVFSTLTSQ		WKDVPVEQVT		HADREQTKKV		VYAVVYGAGK		ERLAACLGVP
IQEAAQFLES		FLQKYKKIKD		FARAAIAQCH		QTGCVVSIMG		RRRPLPRIHA
HDQQLRAQAE		RQAVNFVVQG		SAADLCKLAM		IHVFTAVAAS		HTLTARLVAQ
IHDELLFEVE		DPQIPECAAL		VRRTMESLEQ		VQALELQLQV		PLKVSLSAGR
SWGHLVPLQE		AWGPPPGPCR		TESPSNSLAA		PGSPASTQPP		PLHFSPSFCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Marini F., Kim N., Schuffert A., Wood R.D. (2003). POLN, a nuclear PolA family DNA polymerase homologous to the DNA cross-link sensitivity protein Mus308. J. Biol. Chem. 278: 32014—32019. PMID 12794064 DOI:10.1074/jbc.M305646200
• Takata K., Shimizu T., Iwai S., Wood R.D. (2006). Human DNA polymerase N (POLN) is a low fidelity enzyme capable of error-free bypass of 5S-thymine glycol. J. Biol. Chem. 281: 23445—23455. PMID 16787914 DOI:10.1074/jbc.M604317200
• Arana M.E., Takata K., Garcia-Diaz M., Wood R.D., Kunkel T.A. (2007). A unique error signature for human DNA polymerase nu. DNA Repair. 6: 213—223. PMID 17118716 DOI:10.1016/j.dnarep.2006.09.012
• Zietlow L., Smith L.A., Bessho M., Bessho T. (2009). Evidence for the involvement of human DNA polymerase N in the repair of DNA interstrand cross-links. Biochemistry. 48: 11817—11824. PMID 19908865 DOI:10.1021/bi9015346
• Lee Y.S., Gao Y., Yang W. (2015). How a homolog of high-fidelity replicases conducts mutagenic DNA synthesis. Nat. Struct. Mol. Biol. 22: 298—303. PMID 25775266 DOI:10.1038/nsmb.2985

Див. також

• Хромосома 4