POM121C

POM121C
Ідентифікатори
Символи	POM121C, POM121-2, POM121 transmembrane nucleoporin C
Зовнішні ІД	OMIM: 615754 MGI: 2137624 HomoloGene: 70878 GeneCards: POM121C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • nuclear localization sequence binding Клітинна компонента • ядерна мембрана • integral component of membrane • клітинне ядро • nuclear envelope • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • nuclear pore central transport channel • nuclear pore nuclear basket • ядерна пора • host cell Біологічний процес • GO:0022415 viral process • protein transport • mRNA transport • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • protein import into nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100101267	107939
Ensembl	ENSG00000272391	ENSMUSG00000053293
UniProt	A8CG34	Q8K3Z9
RefSeq (мРНК)	NM_001099415	NM_148932
RefSeq (білок)	NP_001092885	NP_683734
Локус (UCSC)	Хр. 7: 75.42 – 75.49 Mb	Хр. 5: 135.4 – 135.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POM121C (англ. Nuclear envelope pore membrane protein POM 121C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 229 амінокислот, а молекулярна маса — 125 059.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPAAAAAGA		GERRRPIASV		RDGRGRGCGG		PAGAALLGLS		LVGLLLYLVP
AAAALAWLAV		GTTAAWWGLS		REPRGSRPLS		SFVQKARHRR		TLFASPPAKS
TANGNLLEPR		TLLEGPDPAE		LLLMGSYLGK		PGPPQPAPAP		EGQDLRNRPG
RRPPARPAPR		STPPSPPTHR		VHHFYPSLPT		PLLRPSGRPS		PRDRGTLPDR
FVITPRRRYP		IHQTQYSCPG		VLPTVCWNGY		HKKAVLSPRN		SRMVCSPVTV
RIAPPDRRFS		RSAIPEQIIS		STLSSPSSNA		PDPCAKETVL		SALKEKKKKR
TVEEEDQIFL		DGQENKRRRH		DSSGSGHSAF		EPLVASGVPA		SFVPKPGSLK
RGLNSQSSDD		HLNKRSRSSS		MSSLTGAYTS		GIPSSSRNAI		TSSYSSTRGI
SQLWKRNGPS		SSPFSSPASS		RSQTPERPAK		KIREEELCHH		SSSSTPLAAD
KESQGEKAAD		TTPRKKQNSN		SQSTPGSSGQ		RKRKVQLLPS		RRGEQLTLPP
PPQLGYSITA		EDLDLEKKAS		LQWFNQALED		KSDAASNSVT		ETPPTTQPSF
TFTLPAAATA		SPPTSLLAPS		TNPLLESLKK		MQTPPSLPPC		PESAGAATTE
ALSPPKTPSL		LPPLGLSQSG		PPGLLPSPSF		DSKPPTTLLG		LIPAPSMVPA
TDTKAPPTLQ		AETATKPQAT		SAPSPAPKQS		FLFGTQNTSP		SSPAAPAASS
ASPMFKPIFT		APPKSEKEGP		TPPGPSVTAT		APSSSSLPTT		TSTTAPTFQP
VFSSMGPPAS		VPLPAPFFKQ		TTTPATAPTT		TAPLFTGLAS		ATSAVAPITS
ASPSTDSASK		PAFGFGINSV		SSSSVSTTTS		TATAASQPFL		FGAPQASAAS
FTPAMGSIFQ		FGKPPALPTT		TTVTTFSQSL		PTAVPTATSS		SAADFSGFGS
TLATSAPATS		SQPTLTFSNT		STPTFNIPFG		SSAKSPLPSY		PGANPQPAFG
AAEGQPPGAA		KPALTPSFGS		SFTFGNSAAP		APATAPTPAP		ASTIKIVPAH
VPTPIQPTFG		GATHSAFGLK		ATASAFGAPA		SSQPAFGGST		AVFSFGAATS
SGFGATTQTA		SSGSSSSVFG		STTPSPFTFG		GSAAPAGSGS		FGINVATPGS
SATTGAFSFG		AGQSGSTATS		TPFTGGLGQN		ALGTTGQSTP		FAFNVGSTTE
SKPVFGGTAT		PTFGQNTPAP		GVGTSGSSLS		FGASSAPAQG		FVGVGPFGSA
APSFSIGAGS		KTPGARQRLQ		ARRQHTRKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7