POP5

POP5
Ідентифікатори
Символи	POP5, HSPC004, RPP2, RPP20, hPop5, POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 609992 MGI: 2151221 HomoloGene: 41076 GeneCards: POP5
Онтологія гена Молекулярна функція • ribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ribonuclease P activity Клітинна компонента • ядерце • nucleolar ribonuclease P complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ribonuclease MRP complex • multimeric ribonuclease P complex Біологічний процес • RNA metabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA processing • protein lipoylation • tRNA 5'-leader removal • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51367	117109
Ensembl	ENSG00000167272	ENSMUSG00000060152
UniProt	Q969H6	Q9DB28
RefSeq (мРНК)	NM_015918 NM_198201 NM_198202	NM_026398
RefSeq (білок)	NP_057002 NP_937845	NP_080674 NP_001390591
Локус (UCSC)	Хр. 12: 120.58 – 120.58 Mb	Хр. 5: 115.37 – 115.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POP5 (англ. POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 163 амінокислот, а молекулярна маса — 18 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRFKHRYLL		CELVSDDPRC		RLSLDDRVLS		SLVRDTIARV		HGTFGAAACS
IGFAVRYLNA		YTGIVLLRCR		KEFYQLVWSA		LPFITYLENK		GHRYPCFFNT
LHVGGTIRTC		QKFLIQYNRR		QLLILLQNCT		DEGEREAIQK		SVTRSCLLEE
EEESGEEAAE		AME

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• van Eenennaam H., Lugtenberg D., Vogelzangs J.H.P., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2001). hPop5, a protein subunit of the human RNase MRP and RNase P endoribonucleases. J. Biol. Chem. 276: 31635—31641. PMID 11413139 DOI:10.1074/jbc.M103399200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Welting T.J., van Venrooij W.J., Pruijn G.J. (2004). Mutual interactions between subunits of the human RNase MRP ribonucleoprotein complex. Nucleic Acids Res. 32: 2138—2146. PMID 15096576 DOI:10.1093/nar/gkh539

Див. також

• Хромосома 12