PPP1R16B

PPP1R16B
Ідентифікатори
Символи	PPP1R16B, ANKRD4, TIMAP, protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B
Зовнішні ІД	OMIM: 613275 MGI: 2151841 HomoloGene: 9194 GeneCards: PPP1R16B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase regulator activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • nuclear speck • cell projection Біологічний процес • establishment of endothelial barrier • regulation of filopodium assembly • negative regulation of protein dephosphorylation • positive regulation of endothelial cell proliferation • negative regulation of peptidyl-serine dephosphorylation • positive regulation of protein dephosphorylation • positive regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • regulation of protein dephosphorylation • regulation of phosphoprotein phosphatase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26051	228852
Ensembl	ENSG00000101445	ENSMUSG00000037754
UniProt	Q96T49	Q8VHQ3
RefSeq (мРНК)	NM_001172735 NM_015568	NM_001159662 NM_153089
RefSeq (білок)	NP_001166206 NP_056383	NP_001153134 NP_694729
Локус (UCSC)	Хр. 20: 38.81 – 38.92 Mb	Хр. 2: 158.51 – 158.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPP1R16B (англ. Protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 567 амінокислот, а молекулярна маса — 63 551.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASHVDLLTE		LQLLEKVPTL		ERLRAAQKRR		AQQLKKWAQY		EQDLQHRKRK
HERKRSTGGR		RKKVSFEASV		ALLEASLRND		AEEVRYFLKN		KVSPDLCNED
GLTALHQCCI		DNFEEIVKLL		LSHGANVNAK		DNELWTPLHA		AATCGHINLV
KILVQYGADL		LAVNSDGNMP		YDLCEDEPTL		DVIETCMAYQ		GITQEKINEM
RVAPEQQMIA		DIHCMIAAGQ		DLDWIDAQGA		TLLHIAGANG		YLRAAELLLD
HGVRVDVKDW		DGWEPLHAAA		FWGQMQMAEL		LVSHGASLSA		RTSMDEMPID
LCEEEEFKVL		LLELKHKHDV		IMKSQLRHKS		SLSRRTSSAG		SRGKVVRRAS
LSDRTNLYRK		EYEGEAILWQ		RSAAEDQRTS		TYNGDIRETR		TDQENKDPNP
RLEKPVLLSE		FPTKIPRGEL		DMPVENGLRA		PVSAYQYALA		NGDVWKVHEV
PDYSMAYGNP		GVADATPPWS		SYKEQSPQTL		LELKRQRAAA		KLLSHPFLST
HLGSSMARTG		ESSSEGKAPL		IGGRTSPYSS		NGTSVYYTVT		SGDPPLLKFK
APIEEMEEKV		HGCCRIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
• Poirier C., Gorshkov B.A., Zemskova M.A., Bogatcheva N.V., Verin A.D. (2011). TIMAP protects endothelial barrier from LPS-induced vascular leakage and is down-regulated by LPS. Respir. Physiol. Neurobiol. 179: 334—337. PMID 21907835 DOI:10.1016/j.resp.2011.08.012
• Obeidat M., Li L., Ballermann B.J. (2014). TIMAP promotes angiogenesis by suppressing PTEN-mediated Akt inhibition in human glomerular endothelial cells. Am. J. Physiol. 307: F623—F633. PMID 25007873 DOI:10.1152/ajprenal.00070.2014
• Boratko A., Peter M., Thalwieser Z., Kovacs E., Csortos C. (2015). Elongation factor-1A1 is a novel substrate of the protein phosphatase 1-TIMAP complex. Int. J. Biochem. Cell Biol. 69: 105—113. PMID 26497934 DOI:10.1016/j.biocel.2015.10.021

Див. також

• Хромосома 20