PRDM11

PRDM11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3RAY
Ідентифікатори
Символи	PRDM11, PFM8, PR domain 11, PR/SET domain 11
Зовнішні ІД	OMIM: 616347 MGI: 2685553 HomoloGene: 82511 GeneCards: PRDM11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • chromatin DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • regulation of MAPK cascade • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • positive regulation of fibroblast apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56981	100042784
Ensembl	ENSG00000019485	ENSMUSG00000075028
UniProt	Q9NQV5	A2AGX3
RefSeq (мРНК)	NM_001256695 NM_001256696 NM_001359633 NM_001384648 NM_001384649 NM_001384650 NM_001384651	NM_001177536 NM_001368848 NM_001368849
RefSeq (білок)	NP_001243624 NP_001243625 NP_001346562	NP_001171007 NP_001355777 NP_001355778
Локус (UCSC)	Хр. 11: 45.1 – 45.24 Mb	Хр. 2: 92.97 – 93.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM11 (англ. PR/SET domain 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 57 863.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKMAEPIAS		LMIVECRACL		RCSPLFLYQR		EKDRMTENMK		ECLAQTNAAV
GDMVTVVKTE		VCSPLRDQEY		GQPCSRRPDS		SAMEVEPKKL		KGKRDLIVPK
SFQQVDFWFC		ESCQEYFVDE		CPNHGPPVFV		SDTPVPVGIP		DRAALTIPQG
MEVVKDTSGE		SDVRCVNEVI		PKGHIFGPYE		GQISTQDKSA		GFFSWLIVDK
NNRYKSIDGS		DETKANWMRY		VVISREEREQ		NLLAFQHSER		IYFRACRDIR
PGEWLRVWYS		EDYMKRLHSM		SQETIHRNLA		RGEKRLQREK		SEQVLDNPED
LRGPIHLSVL		RQGKSPYKRG		FDEGDVHPQA		KKKKIDLIFK		DVLEASLESA
KVEAHQLALS		TSLVIRKVPK		YQDDAYSQCA		TTMTHGVQNI		GQTQGEGDWK
VPQGVSKEPG		QLEDEEEEPS		SFKADSPAEA		SLASDPHELP		TTSFCPNCIR
LKKKVRELQA		ELDMLKSGKL		PEPPVLPPQV		LELPEFSDPA		GKLVWMRLLS
EGRVRSGLCG		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Див. також

• Хромосома 11