PRDM12

PRDM12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EP0
Ідентифікатори
Символи	PRDM12, PFM9, HSAN8, PR domain 12, PR/SET domain 12
Зовнішні ІД	OMIM: 616458 MGI: 2685844 HomoloGene: 10999 GeneCards: PRDM12
Пов'язані генетичні захворювання
hereditary sensory and autonomic neuropathy type 8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • histone methyltransferase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • Нейрогенез • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of histone H3-K9 dimethylation • sensory perception of pain • neuron projection development • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • positive regulation of histone H3-K9 methylation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59335	381359
Ensembl	ENSG00000130711	ENSMUSG00000079466
UniProt	Q9H4Q4	A2AJ77
RefSeq (мРНК)	NM_021619	NM_001123362
RefSeq (білок)	NP_067632	NP_001116834
Локус (UCSC)	Хр. 9: 130.66 – 130.68 Mb	Хр. 2: 31.53 – 31.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM12 (англ. PR/SET domain 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 40 403.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMGSVLPAEA		LVLKTGLKAP		GLALAEVITS		DILHSFLYGR		WRNVLGEQLF
EDKSHHASPK		TAFTAEVLAQ		SFSGEVQKLS		SLVLPAEVII		AQSSIPGEGL
GIFSKTWIKA		GTEMGPFTGR		VIAPEHVDIC		KNNNLMWEVF		NEDGTVRYFI
DASQEDHRSW		MTYIKCARNE		QEQNLEVVQI		GTSIFYKAIE		MIPPDQELLV
WYGNSHNTFL		GIPGVPGLEE		DQKKNKHEDF		HPADSAAGPA		GRMRCVICHR
GFNSRSNLRS		HMRIHTLDKP		FVCRFCNRRF		SQSSTLRNHV		RLHTGERPYK
CQVCQSAYSQ		LAGLRAHQKS		ARHRPPSTAL		QAHSPALPAP		HAHAPALAAA
AAAAAAAAAH		HLPAMVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Див. також

• Хромосома 9