PRICKLE1

PRICKLE1
Ідентифікатори
Символи	PRICKLE1, EPM1B, RILP, prickle planar cell polarity protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608500 MGI: 1916034 HomoloGene: 17686 GeneCards: PRICKLE1
Пов'язані генетичні захворювання
Unverricht-Lundborg syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Ядерна мембрана • клітинне ядро • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • coronary vasculature development • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neural tube closure • aorta development • negative regulation of cardiac muscle cell myoblast differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • protein import into nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	144165	106042
Ensembl	ENSG00000139174	ENSMUSG00000036158
UniProt	Q96MT3	Q3U5C7
RefSeq (мРНК)	NM_001144881 NM_001144882 NM_001144883 NM_153026	NM_001033217 NM_001364846
RefSeq (білок)	NP_001138353 NP_001138354 NP_001138355 NP_694571	NP_001028389 NP_001351775
Локус (UCSC)	Хр. 12: 42.46 – 42.59 Mb	Хр. 15: 93.4 – 93.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRICKLE1 (англ. Prickle planar cell polarity protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 831 амінокислот, а молекулярна маса — 94 300.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLEMEPKMS		KLAFGCQRSS		TSDDDSGCAL		EEYAWVPPGL		RPEQIQLYFA
CLPEEKVPYV		NSPGEKHRIK		QLLYQLPPHD		NEVRYCQSLS		EEEKKELQVF
SAQRKKEALG		RGTIKLLSRA		VMHAVCEQCG		LKINGGEVAV		FASRAGPGVC
WHPSCFVCFT		CNELLVDLIY		FYQDGKIHCG		RHHAELLKPR		CSACDEIIFA
DECTEAEGRH		WHMKHFCCLE		CETVLGGQRY		IMKDGRPFCC		GCFESLYAEY
CETCGEHIGV		DHAQMTYDGQ		HWHATEACFS		CAQCKASLLG		CPFLPKQGQI
YCSKTCSLGE		DVHASDSSDS		AFQSARSRDS		RRSVRMGKSS		RSADQCRQSL
LLSPALNYKF		PGLSGNADDT		LSRKLDDLSL		SRQGTSFASE		EFWKGRVEQE
TPEDPEEWAD		HEDYMTQLLL		KFGDKSLFQP		QPNEMDIRAS		EHWISDNMVK
SKTELKQNNQ		SLASKKYQSD		MYWAQSQDGL		GDSAYGSHPG		PASSRRLQEL
ELDHGASGYN		HDETQWYEDS		LECLSDLKPE		QSVRDSMDSL		ALSNITGASV
DGENKPRPSL		YSLQNFEEME		TEDCEKMSNM		GTLNSSMLHR		SAESLKSLSS
ELCPEKILPE		EKPVHLPVLR		RSKSQSRPQQ		VKFSDDVIDN		GNYDIEIRQP
PMSERTRRRV		YNFEERGSRS		HHHRRRRSRK		SRSDNALNLV		TERKYSPKDR
LRLYTPDNYE		KFIQNKSARE		IQAYIQNADL		YGQYAHATSD		YGLQNPGMNR
FLGLYGEDDD		SWCSSSSSSS		DSEEEGYFLG		QPIPQPRPQR		FAYYTDDLSS
PPSALPTPQF		GQRTTKSKKK		KGHKGKNCII		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Shimojo M., Hersh L.B. (2003). REST/NRSF-interacting LIM domain protein, a putative nuclear translocation receptor. Mol. Cell. Biol. 23: 9025—9031. PMID 14645515 DOI:10.1128/MCB.23.24.9025-9031.2003
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of human PRICKLE1 and PRICKLE2 genes as well as mouse Prickle1 and Prickle2 genes homologous to Drosophila tissue polarity gene prickle. Int. J. Mol. Med. 11: 249—256. PMID 12525887

Див. також

• Хромосома 12