PRKAG1

PRKAG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2UV4, 2UV5, 2UV6, 2UV7, 4CFE, 4CFF, 4RER, 4REW, 5EZV, 4ZHX
Ідентифікатори
Символи	PRKAG1, AMPKG, protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602742 MGI: 108411 HomoloGene: 99712 GeneCards: PRKAG1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein kinase activity • cAMP-dependent protein kinase activity • ADP binding • AMP-activated protein kinase activity • AMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cAMP-dependent protein kinase regulator activity • protein kinase binding • ATP binding • adenyl ribonucleotide binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • nucleotide-activated protein kinase complex • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • lipid metabolism • fatty acid metabolic process • regulation of glycolytic process • protein phosphorylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • fatty acid biosynthetic process • Сперматогенез • macroautophagy • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of macroautophagy • import into nucleus • regulation of protein serine/threonine kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5571	19082
Ensembl	ENSG00000181929	ENSMUSG00000067713
UniProt	P54619	O54950
RefSeq (мРНК)	NM_001206709 NM_001206710 NM_002733 NM_212461	NM_016781
RefSeq (білок)	NP_001193638 NP_001193639 NP_002724	NP_058061
Локус (UCSC)	Хр. 12: 49 – 49.02 Mb	Хр. 15: 98.71 – 98.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRKAG1 (англ. Protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 37 579.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METVISSDSS		PAVENEHPQE		TPESNNSVYT		SFMKSHRCYD		LIPTSSKLVV
FDTSLQVKKA		FFALVTNGVR		AAPLWDSKKQ		SFVGMLTITD		FINILHRYYK
SALVQIYELE		EHKIETWREV		YLQDSFKPLV		CISPNASLFD		AVSSLIRNKI
HRLPVIDPES		GNTLYILTHK		RILKFLKLFI		TEFPKPEFMS		KSLEELQIGT
YANIAMVRTT		TPVYVALGIF		VQHRVSALPV		VDEKGRVVDI		YSKFDVINLA
AEKTYNNLDV		SVTKALQHRS		HYFEGVLKCY		LHETLETIIN		RLVEAEVHRL
VVVDENDVVK		GIVSLSDILQ		ALVLTGGEKK		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Scott J.W., Ross F.A., Liu J.K., Hardie D.G. (2007). Regulation of AMP-activated protein kinase by a pseudosubstrate sequence on the gamma subunit. EMBO J. 26: 806—815. PMID 17255938 DOI:10.1038/sj.emboj.7601542
• Towler M.C., Hardie D.G. (2007). AMP-activated protein kinase in metabolic control and insulin signaling. Circ. Res. 100: 328—341. PMID 17307971 DOI:10.1161/01.RES.0000256090.42690.05
• Hardie D.G. (2007). AMP-activated/SNF1 protein kinases: conserved guardians of cellular energy. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8: 774—785. PMID 17712357 DOI:10.1038/nrm2249

Див. також

• Хромосома 12