PRPF3

PRPF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X4Q, 3JCR
Ідентифікатори
Символи	PRPF3, pre-mRNA processing factor 3, HPRP3, HPRP3P, PRP3, Prp3p, RP18, SNRNP90
Зовнішні ІД	OMIM: 607301 MGI: 1918017 HomoloGene: 3447 GeneCards: PRPF3
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 18
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9129	70767
Ensembl	ENSG00000117360	ENSMUSG00000015748
UniProt	O43395	Q922U1
RefSeq (мРНК)	NM_004698 NM_001350529	NM_027541 NM_001316751
RefSeq (білок)	NP_004689 NP_001337458	NP_001303680 NP_081817
Локус (UCSC)	Хр. 1: 150.32 – 150.35 Mb	Хр. 3: 95.74 – 95.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF3 (англ. Pre-mRNA processing factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 77 529.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALSKRELDE		LKPWIEKTVK		RVLGFSEPTV		VTAALNCVGK		GMDKKKAADH
LKPFLDDSTL		RFVDKLFEAV		EEGRSSRHSK		SSSDRSRKRE		LKEVFGDDSE
ISKESSGVKK		RRIPRFEEVE		EEPEVIPGPP		SESPGMLTKL		QIKQMMEAAT
RQIEERKKQL		SFISPPTPQP		KTPSSSQPER		LPIGNTIQPS		QAATFMNDAI
EKARKAAELQ		ARIQAQLALK		PGLIGNANMV		GLANLHAMGI		APPKVELKDQ
TKPTPLILDE		QGRTVDATGK		EIELTHRMPT		LKANIRAVKR		EQFKQQLKEK
PSEDMESNTF		FDPRVSIAPS		QRQRRTFKFH		DKGKFEKIAQ		RLRTKAQLEK
LQAEISQAAR		KTGIHTSTRL		ALIAPKKELK		EGDIPEIEWW		DSYIIPNGFD
LTEENPKRED		YFGITNLVEH		PAQLNPPVDN		DTPVTLGVYL		TKKEQKKLRR
QTRREAQKEL		QEKVRLGLMP		PPEPKVRISN		LMRVLGTEAV		QDPTKVEAHV
RAQMAKRQKA		HEEANAARKL		TAEQRKVKKI		KKLKEDISQG		VHISVYRVRN
LSNPAKKFKI		EANAGQLYLT		GVVVLHKDVN		VVVVEGGPKA		QKKFKRLMLH
RIKWDEQTSN		TKGDDDEESD		EEAVKKTNKC		VLVWEGTAKD		RSFGEMKFKQ
CPTENMAREH		FKKHGAEHYW		DLALSESVLE		STD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Medenbach J., Schreiner S., Liu S., Luhrmann R., Bindereif A. (2004). Human U4/U6 snRNP recycling factor p110: mutational analysis reveals the function of the tetratricopeptide repeat domain in recycling. Mol. Cell. Biol. 24: 7392—7401. PMID 15314151 DOI:10.1128/MCB.24.17.7392-7401.2004
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• Gonzalez-Santos J.M., Cao H., Duan R.C., Hu J. (2008). Mutation in the splicing factor Hprp3p linked to retinitis pigmentosa impairs interactions within the U4/U6 snRNP complex. Hum. Mol. Genet. 17: 225—239. PMID 17932117 DOI:10.1093/hmg/ddm300
• Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1997). A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs. RNA. 3: 1374—1387. PMID 9404889

Див. також

• Хромосома 1