PSMC6

PSMC6
Ідентифікатори
Символи	PSMC6, CADP44, HEL-S-73, P44, SUG2, p42, proteasome 26S subunit, ATPase 6, RPT5
Зовнішні ІД	OMIM: 602708 MGI: 1914339 HomoloGene: 100630 GeneCards: PSMC6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein-macromolecule adaptor activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TBP-class protein binding • ATP binding • hydrolase activity • identical protein binding • proteasome-activating activity Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear proteasome complex • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • мембрана • proteasome accessory complex • нуклеоплазма • cytosolic proteasome complex • Протеасома • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • ubiquitin-dependent ERAD pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5706	67089
Ensembl	ENSG00000100519	ENSMUSG00000021832
UniProt	P62333	P62334
RefSeq (мРНК)	NM_002806 NM_001366414	NM_025959
RefSeq (білок)	NP_002797 NP_001353343	NP_080235
Локус (UCSC)	Хр. 14: 52.71 – 52.73 Mb	Хр. 14: 45.57 – 45.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMC6 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 44 173.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADPRDKALQ		DYRKKLLEHK		EIDGRLKELR		EQLKELTKQY		EKSENDLKAL
QSVGQIVGEV		LKQLTEEKFI		VKATNGPRYV		VGCRRQLDKS		KLKPGTRVAL
DMTTLTIMRY		LPREVDPLVY		NMSHEDPGNV		SYSEIGGLSE		QIRELREVIE
LPLTNPELFQ		RVGIIPPKGC		LLYGPPGTGK		TLLARAVASQ		LDCNFLKVVS
SSIVDKYIGE		SARLIREMFN		YARDHQPCII		FMDEIDAIGG		RRFSEGTSAD
REIQRTLMEL		LNQMDGFDTL		HRVKMIMATN		RPDTLDPALL		RPGRLDRKIH
IDLPNEQARL		DILKIHAGPI		TKHGEIDYEA		IVKLSDGFNG		ADLRNVCTEA
GMFAIRADHD		FVVQEDFMKA		VRKVADSKKL		ESKLDYKPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Fujiwara T., Watanabe T.K., Tanaka K., Slaughter C.A., Demartino G.N. (1996). cDNA cloning of p42, a shared subunit of two proteasome regulatory proteins, reveals a novel member of the AAA protein family. FEBS Lett. 387: 184—188. PMID 8674546 DOI:10.1016/0014-5793(96)00489-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Див. також

• Хромосома 14