PSMD11

PSMD11
Ідентифікатори
Символи	PSMD11, Rpn6, S9, p44.5, proteasome 26S subunit, non-ATPase 11
Зовнішні ІД	OMIM: 604449 MGI: 1916327 HomoloGene: 2108 GeneCards: PSMD11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • proteasome accessory complex • proteasome regulatory particle • Нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • proteasome regulatory particle, lid subcomplex • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stem cell differentiation • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • proteasome assembly • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5717	69077
Ensembl	ENSG00000108671	ENSMUSG00000017428
UniProt	O00231	Q8BG32
RefSeq (мРНК)	NM_002815 NM_001270482	NM_178616
RefSeq (білок)	NP_001257411 NP_002806	NP_848731
Локус (UCSC)	Хр. 17: 32.44 – 32.48 Mb	Хр. 11: 80.32 – 80.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMD11 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 422 амінокислот, а молекулярна маса — 47 464.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAVVEFQ		RAQSLLSTDR		EASIDILHSI		VKRDIQENDE		EAVQVKEQSI
LELGSLLAKT		GQAAELGGLL		KYVRPFLNSI		SKAKAARLVR		SLLDLFLDME
AATGQEVELC		LECIEWAKSE		KRTFLRQALE		ARLVSLYFDT		KRYQEALHLG
SQLLRELKKM		DDKALLVEVQ		LLESKTYHAL		SNLPKARAAL		TSARTTANAI
YCPPKLQATL		DMQSGIIHAA		EEKDWKTAYS		YFYEAFEGYD		SIDSPKAITS
LKYMLLCKIM		LNTPEDVQAL		VSGKLALRYA		GRQTEALKCV		AQASKNRSLA
DFEKALTDYR		AELRDDPIIS		THLAKLYDNL		LEQNLIRVIE		PFSRVQIEHI
SSLIKLSKAD		VERKLSQMIL		DKKFHGILDQ		GEGVLIIFDE		PPVDKTYEAA
LETIQNMSKV		VDSLYNKAKK		LT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Hoffman L., Rechsteiner M. (1997). Molecular cloning and expression of subunit 9 of the 26S proteasome. FEBS Lett. 404: 179—184. PMID 9119060 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00126-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Moreno D., Viana R., Sanz P. (2009). Two-hybrid analysis identifies PSMD11, a non-ATPase subunit of the proteasome, as a novel interaction partner of AMP-activated protein kinase. Int. J. Biochem. Cell Biol. 41: 2431—2439. PMID 19616115 DOI:10.1016/j.biocel.2009.07.002
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Див. також

• Хромосома 17