PSME4

PSME4
Ідентифікатори
Символи	PSME4, PA200, proteasome activator subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 607705 MGI: 2143994 HomoloGene: 113742 GeneCards: PSME4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidase activator activity • lysine-acetylated histone binding • proteasome binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • Протеасома • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • proteasome core complex • spermatoproteasome complex Біологічний процес • диференціація клітин • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of peptidase activity • multicellular organism development • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Сперматогенез • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0100026 Репарація ДНК • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23198	103554
Ensembl	ENSG00000068878	ENSMUSG00000040850
UniProt	Q14997	Q5SSW2
RefSeq (мРНК)	NM_014614	NM_134013
RefSeq (білок)	NP_055429	NP_598774
Локус (UCSC)	Хр. 2: 53.86 – 53.97 Mb	Хр. 11: 30.72 – 30.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSME4 (англ. Proteasome activator subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 843 амінокислот, а молекулярна маса — 211 334.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPAERAGVG		EPPEPGGRPE		PGPRGFVPQK		EIVYNKLLPY		AERLDAESDL
QLAQIKCNLG		RAVQLQELWP		GGLFWTRKLS		TYIRLYGRKF		SKEDHVLFIK
LLYELVSIPK		LEISMMQGFA		RLLINLLKKK		ELLSRADLEL		PWRPLYDMVE
RILYSKTEHL		GLNWFPNSVE		NILKTLVKSC		RPYFPADATA		EMLEEWRPLM
CPFDVTMQKA		ITYFEIFLPT		SLPPELHHKG		FKLWFDELIG		LWVSVQNLPQ
WEGQLVNLFA		RLATDNIGYI		DWDPYVPKIF		TRILRSLNLP		VGSSQVLVPR
FLTNAYDIGH		AVIWITAMMG		GPSKLVQKHL		AGLFNSITSF		YHPSNNGRWL
NKLMKLLQRL		PNSVVRRLHR		ERYKKPSWLT		PVPDSHKLTD		QDVTDFVQCI
IQPVLLAMFS		KTGSLEAAQA		LQNLALMRPE		LVIPPVLERT		YPALETLTEP
HQLTATLSCV		IGVARSLVSG		GRWFPEGPTH		MLPLLMRALP		GVDPNDFSKC
MITFQFIATF		STLVPLVDCS		SVLQERNDLT		EVERELCSAT		AEFEDFVLQF
MDRCFGLIES		STLEQTREET		ETEKMTHLES		LVELGLSSTF		STILTQCSKE
IFMVALQKVF		NFSTSHIFET		RVAGRMVADM		CRAAVKCCPE		ESLKLFVPHC
CSVITQLTMN		DDVLNDEELD		KELLWNLQLL		SEITRVDGRK		LLLYREQLVK
ILQRTLHLTC		KQGYTLSCNL		LHHLLRSTTL		IYPTEYCSVP		GGFDKPPSEY
FPIKDWGKPG		DLWNLGIQWH		VPSSEEVSFA		FYLLDSFLQP		ELVKLQHCGD
GKLEMSRDDI		LQSLTIVHNC		LIGSGNLLPP		LKGEPVTNLV		PSMVSLEETK
LYTGLEYDLS		RENHREVIAT		VIRKLLNHIL		DNSEDDTKSL		FLIIKIIGDL
LQFQGSHKHE		FDSRWKSFNL		VKKSMENRLH		GKKQHIRALL		IDRVMLQHEL
RTLTVEGCEY		KKIHQDMIRD		LLRLSTSSYS		QVRNKAQQTF		FAALGAYNFC
CRDIIPLVLE		FLRPDRQGVT		QQQFKGALYC		LLGNHSGVCL		ANLHDWDCIV
QTWPAIVSSG		LSQAMSLEKP		SIVRLFDDLA		EKIHRQYETI		GLDFTIPKSC
VEIAELLQQS		KNPSINQILL		SPEKIKEGIK		RQQEKNADAL		RNYENLVDTL
LDGVEQRNLP		WKFEHIGIGL		LSLLLRDDRV		LPLRAIRFFV		ENLNHDAIVV
RKMAISAVAG		ILKQLKRTHK		KLTINPCEIS		GCPKPTQIIA		GDRPDNHWLH
YDSKTIPRTK		KEWESSCFVE		KTHWGYYTWP		KNMVVYAGVE		EQPKLGRSRE
DMTEAEQIIF		DHFSDPKFVE		QLITFLSLED		RKGKDKFNPR		RFCLFKGIFR
NFDDAFLPVL		KPHLEHLVAD		SHESTQRCVA		EIIAGLIRGS		KHWTFEKVEK
LWELLCPLLR		TALSNITVET		YNDWGACIAT		SCESRDPRKL		HWLFELLLES
PLSGEGGSFV		DACRLYVLQG		GLAQQEWRVP		ELLHRLLKYL		EPKLTQVYKN
VRERIGSVLT		YIFMIDVSLP		NTTPTISPHV		PEFTARILEK		LKPLMDVDEE
IQNHVMEENG		IGEEDERTQG		IKLLKTILKW		LMASAGRSFS		TAVTEQLQLL
PLFFKIAPVE		NDNSYDELKR		DAKLCLSLMS		QGLLYPHQVP		LVLQVLKQTA
RSSSWHARYT		VLTYLQTMVF		YNLFIFLNNE		DAVKDIRWLV		ISLLEDEQLE
VREMAATTLS		GLLQCNFLTM		DSPMQIHFEQ		LCKTKLPKKR		KRDPGSVGDT
IPSAELVKRH		AGVLGLGACV		LSSPYDVPTW		MPQLLMNLSA		HLNDPQPIEM
TVKKTLSNFR		RTHHDNWQEH		KQQFTDDQLL		VLTDLLVSPC		YYA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, диференціація, сперматогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ustrell V., Hoffman L., Pratt G., Rechsteiner M. (2002). PA200, a nuclear proteasome activator involved in DNA repair. EMBO J. 21: 3516—3525. PMID 12093752 DOI:10.1093/emboj/cdf333

Див. також

• Хромосома 2