PTPN13

PTPN13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D5G, 1Q7X, 1WCH, 2M0Z, 2M10, 3LNX, 3LNY, 3PDZ
Ідентифікатори
Символи	PTPN13, FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13
Зовнішні ІД	OMIM: 600267 MGI: 103293 HomoloGene: 7909 GeneCards: PTPN13
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • neuron projection • cell projection • екзосома • Цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • клітинна мембрана • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • phosphatidylinositol biosynthetic process • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • cellular response to cytokine stimulus • bicellular tight junction assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5783	19249
Ensembl	ENSG00000163629	ENSMUSG00000034573
UniProt	Q12923	Q64512
RefSeq (мРНК)	NM_006264 NM_080683 NM_080684 NM_080685	NM_011204
RefSeq (білок)	NP_006255 NP_542414 NP_542415 NP_542416	NP_035334
Локус (UCSC)	Хр. 4: 86.59 – 86.82 Mb	Хр. 5: 103.57 – 103.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPN13 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 485 амінокислот, а молекулярна маса — 276 906.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHVSLAEALE		VRGGPLQEEE		IWAVLNQSAE		SLQELFRKVS		LADPAALGFI
ISPWSLLLLP		SGSVSFTDEN		ISNQDLRAFT		APEVLQNQSL		TSLSDVEKIH
IYSLGMTLYW		GADYEVPQSQ		PIKLGDHLNS		ILLGMCEDVI		YARVSVRTVL
DACSAHIRNS		NCAPSFSYVK		HLVKLVLGNL		SGTDQLSCNS		EQKPDRSQAI
RDRLRGKGLP		TGRSSTSDVL		DIQKPPLSHQ		TFLNKGLSKS		MGFLSIKDTQ
DENYFKDILS		DNSGREDSEN		TFSPYQFKTS		GPEKKPIPGI		DVLSKKKIWA
SSMDLLCTAD		RDFSSGETAT		YRRCHPEAVT		VRTSTTPRKK		EARYSDGSIA
LDIFGPQKMD		PIYHTRELPT		SSAISSALDR		IRERQKKLQV		LREAMNVEEP
VRRYKTYHGD		VFSTSSESPS		IISSESDFRQ		VRRSEASKRF		ESSSGLPGVD
ETLSQGQSQR		PSRQYETPFE		GNLINQEIML		KRQEEELMQL		QAKMALRQSR
LSLYPGDTIK		ASMLDITRDP		LREIALETAM		TQRKLRNFFG		PEFVKMTIEP
FISLDLPRSI		LTKKGKNEDN		RRKVNIMLLN		GQRLELTCDT		KTICKDVFDM
VVAHIGLVEH		HLFALATLKD		NEYFFVDPDL		KLTKVAPEGW		KEEPKKKTKA
TVNFTLFFRI		KFFMDDVSLI		QHTLTCHQYY		LQLRKDILEE		RMHCDDETSL
LLASLALQAE		YGDYQPEVHG		VSYFRMEHYL		PARVMEKLDL		SYIKEELPKL
HNTYVGASEK		ETELEFLKVC		QRLTEYGVHF		HRVHPEKKSQ		TGILLGVCSK
GVLVFEVHNG		VRTLVLRFPW		RETKKISFSK		KKITLQNTSD		GIKHGFQTDN
SKICQYLLHL		CSYQHKFQLQ		MRARQSNQDA		QDIERASFRS		LNLQAESVRG
FNMGRAISTG		SLASSTLNKL		AVRPLSVQAE		ILKRLSCSEL		SLYQPLQNSS
KEKNDKASWE		EKPREMSKSY		HDLSQASLYP		HRKNVIVNME		PPPQTVAELV
GKPSHQMSRS		DAESLAGVTK		LNNSKSVASL		NRSPERRKHE		SDSSSIEDPG
QAYVLGMTMH		SSGNSSSQVP		LKENDVLHKR		WSIVSSPERE		ITLVNLKKDA
KYGLGFQIIG		GEKMGRLDLG		IFISSVAPGG		PADLDGCLKP		GDRLISVNSV
SLEGVSHHAA		IEILQNAPED		VTLVISQPKE		KISKVPSTPV		HLTNEMKNYM
KKSSYMQDSA		IDSSSKDHHW		SRGTLRHISE		NSFGPSGGLR		EGSLSSQDSR
TESASLSQSQ		VNGFFASHLG		DQTWQESQHG		SPSPSVISKA		TEKETFTDSN
QSKTKKPGIS		DVTDYSDRGD		SDMDEATYSS		SQDHQTPKQE		SSSSVNTSNK
MNFKTFSSSP		PKPGDIFEVE		LAKNDNSLGI		SVTGGVNTSV		RHGGIYVKAV
IPQGAAESDG		RIHKGDRVLA		VNGVSLEGAT		HKQAVETLRN		TGQVVHLLLE
KGQSPTSKEH		VPVTPQCTLS		DQNAQGQGPE		KVKKTTQVKD		YSFVTEENTF
EVKLFKNSSG		LGFSFSREDN		LIPEQINASI		VRVKKLFPGQ		PAAESGKIDV
GDVILKVNGA		SLKGLSQQEV		ISALRGTAPE		VFLLLCRPPP		GVLPEIDTAL
LTPLQSPAQV		LPNSSKDSSQ		PSCVEQSTSS		DENEMSDKSK		KQCKSPSRRD
SYSDSSGSGE		DDLVTAPANI		SNSTWSSALH		QTLSNMVSQA		QSHHEAPKSQ
EDTICTMFYY		PQKIPNKPEF		EDSNPSPLPP		DMAPGQSYQP		QSESASSSSM
DKYHIHHISE		PTRQENWTPL		KNDLENHLED		FELEVELLIT		LIKSEKGSLG
FTVTKGNQRI		GCYVHDVIQD		PAKSDGRLKP		GDRLIKVNDT		DVTNMTHTDA
VNLLRAASKT		VRLVIGRVLE		LPRIPMLPHL		LPDITLTCNK		EELGFSLCGG
HDSLYQVVYI		SDINPRSVAA		IEGNLQLLDV		IHYVNGVSTQ		GMTLEEVNRA
LDMSLPSLVL		KATRNDLPVV		PSSKRSAVSA		PKSTKGNGSY		SVGSCSQPAL
TPNDSFSTVA		GEEINEISYP		KGKCSTYQIK		GSPNLTLPKE		SYIQEDDIYD
DSQEAEVIQS		LLDVVDEEAQ		NLLNENNAAG		YSCGPGTLKM		NGKLSEERTE
DTDCDGSPLP		EYFTEATKMN		GCEEYCEEKV		KSESLIQKPQ		EKKTDDDEIT
WGNDELPIER		TNHEDSDKDH		SFLTNDELAV		LPVVKVLPSG		KYTGANLKSV
IRVLRGLLDQ		GIPSKELENL		QELKPLDQCL		IGQTKENRRK		NRYKNILPYD
ATRVPLGDEG		GYINASFIKI		PVGKEEFVYI		ACQGPLPTTV		GDFWQMIWEQ
KSTVIAMMTQ		EVEGEKIKCQ		RYWPNILGKT		TMVSNRLRLA		LVRMQQLKGF
VVRAMTLEDI		QTREVRHISH		LNFTAWPDHD		TPSQPDDLLT		FISYMRHIHR
SGPIITHCSA		GIGRSGTLIC		IDVVLGLISQ		DLDFDISDLV		RCMRLQRHGM
VQTEDQYIFC		YQVILYVLTR		LQAEEEQKQQ		PQLLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

• Maekawa K., Imagawa N., Nagamatsu M., Harada S. (1994). Molecular cloning of a novel protein-tyrosine phosphatase containing a membrane-binding domain and GLGF repeats. FEBS Lett. 337: 200—206. PMID 8287977 DOI:10.1016/0014-5793(94)80273-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sato T., Irie S., Kitada S., Reed J.C. (1995). FAP-1: a protein tyrosine phosphatase that associates with Fas. Science. 268: 411—415. PMID 7536343 DOI:10.1126/science.7536343
• Murthy K.K., Clark K., Fortin Y., Shen S.-H., Banville D. (1999). ZRP-1, a zyxin-related protein, interacts with the second PDZ domain of the cytosolic protein tyrosine phosphatase hPTP1E. J. Biol. Chem. 274: 20679—20687. PMID 10400701 DOI:10.1074/jbc.274.29.20679
• Gross C., Heumann R., Erdmann K.S. (2001). The protein kinase C-related kinase PRK2 interacts with the protein tyrosine phosphatase PTP-BL via a novel PDZ domain binding motif. FEBS Lett. 496: 101—104. PMID 11356191 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02401-2
• Kimber W.A., Deak M., Prescott A.R., Alessi D.R. (2003). Interaction of the protein tyrosine phosphatase PTPL1 with the PtdIns(3,4)P2-binding adaptor protein TAPP1. Biochem. J. 376: 525—535. PMID 14516276 DOI:10.1042/BJ20031154

Див. також

• Хромосома 4