PTPN6

PTPN6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FPR, 1GWZ, 1X6C, 2B3O, 2RMX, 2YU7, 3PS5, 4GRY, 4GRZ, 4GS0, 4HJP, 4HJQ
Ідентифікатори
Символи	PTPN6, HCP, HCPH, HPTP1C, PTP-1C, SH-PTP1, SHP-1, SHP-1L, SHP1, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 6
Зовнішні ІД	OMIM: 176883 MGI: 96055 HomoloGene: 56589 GeneCards: PTPN6
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • SH3 domain binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphotyrosine residue binding • SH2 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • protein kinase binding • cell adhesion molecule binding • protein tyrosine phosphatase activity • phosphorylation-dependent protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • cell-cell junction • alpha-beta T cell receptor complex • ядерце • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • specific granule lumen • tertiary granule lumen • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • B cell receptor signaling pathway • megakaryocyte development • G protein-coupled receptor signaling pathway • диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • abortive mitotic cell cycle • T cell costimulation • GO:0016576 protein dephosphorylation • Тромбоцитопоез • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • platelet activation • negative regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of T cell proliferation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of MAP kinase activity • hematopoietic progenitor cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of MAPK cascade • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of B cell receptor signaling pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • проліферація • platelet aggregation • regulation of B cell differentiation • leukocyte migration • natural killer cell mediated cytotoxicity • negative regulation of cell population proliferation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • GO:0097285 апоптоз • neutrophil degranulation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of tumor necrosis factor production • cellular response to cytokine stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5777	15170
Ensembl	ENSG00000111679	ENSMUSG00000004266
UniProt	P29350	P29351
RefSeq (мРНК)	NM_002831 NM_080548 NM_080549	NM_001077705 NM_013545
RefSeq (білок)	NP_002822 NP_536858 NP_536859	NP_001071173 NP_038573
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.95 – 6.96 Mb	Хр. 6: 124.7 – 124.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPN6 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 67 561.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRWFHRDLS		GLDAETLLKG		RGVHGSFLAR		PSRKNQGDFS		LSVRVGDQVT
HIRIQNSGDF		YDLYGGEKFA		TLTELVEYYT		QQQGVLQDRD		GTIIHLKYPL
NCSDPTSERW		YHGHMSGGQA		ETLLQAKGEP		WTFLVRESLS		QPGDFVLSVL
SDQPKAGPGS		PLRVTHIKVM		CEGGRYTVGG		LETFDSLTDL		VEHFKKTGIE
EASGAFVYLR		QPYYATRVNA		ADIENRVLEL		NKKQESEDTA		KAGFWEEFES
LQKQEVKNLH		QRLEGQRPEN		KGKNRYKNIL		PFDHSRVILQ		GRDSNIPGSD
YINANYIKNQ		LLGPDENAKT		YIASQGCLEA		TVNDFWQMAW		QENSRVIVMT
TREVEKGRNK		CVPYWPEVGM		QRAYGPYSVT		NCGEHDTTEY		KLRTLQVSPL
DNGDLIREIW		HYQYLSWPDH		GVPSEPGGVL		SFLDQINQRQ		ESLPHAGPII
VHCSAGIGRT		GTIIVIDMLM		ENISTKGLDC		DIDIQKTIQM		VRAQRSGMVQ
TEAQYKFIYV		AIAQFIETTK		KKLEVLQSQK		GQESEYGNIT		YPPAMKNAHA
KASRTSSKHK		EDVYENLHTK		NKREEKVKKQ		RSADKEKSKG		SLKRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Yi T., Cleveland J.L., Ihle J.N. (1992). Protein tyrosine phosphatase containing SH2 domains: characterization, preferential expression in hematopoietic cells, and localization to human chromosome 12p12-p13. Mol. Cell. Biol. 12: 836—846. PMID 1732748 DOI:10.1128/MCB.12.2.836
• Shen S.H., Bastien L., Posner B.I., Chretien P. (1991). A protein-tyrosine phosphatase with sequence similarity to the SH2 domain of the protein-tyrosine kinases. Nature. 352: 736—739. PMID 1652101 DOI:10.1038/352736a0
• Plutzky J., Neel B.G., Rosenberg R.D. (1992). Isolation of a src homology 2-containing tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1123—1127. PMID 1736296 DOI:10.1073/pnas.89.3.1123
• Banville D., Stocco R., Shen S.H. (1995). Human protein tyrosine phosphatase 1C (PTPN6) gene structure: alternate promoter usage and exon skipping generate multiple transcripts. Genomics. 27: 165—173. PMID 7665165 DOI:10.1006/geno.1995.1020
• Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination. Genome Res. 7: 268—280. PMID 9074930 DOI:10.1101/gr.7.3.268
• Jin Y.J., Yu C.L., Burakoff S.J. (1999). Human 70-kDa SHP-1L differs from 68-kDa SHP-1 in its C-terminal structure and catalytic activity. J. Biol. Chem. 274: 28301—28307. PMID 10497187 DOI:10.1074/jbc.274.40.28301

Див. також

• Хромосома 12