PTPRF

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук
PTPRF
Protein PTPRF PDB 1lar.png
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRF, LAR, BNAH2, protein tyrosine phosphatase, receptor type F
Зовнішні ІД MGI: 102695 HomoloGene: 20623 GeneCards: PTPRF
Пов'язані генетичні захворювання
Аміотрофічний бічний склероз[1]
Шаблон експресії
PBB GE PTPRF 200636 s at fs.png

PBB GE PTPRF 200635 s at fs.png

PBB GE PTPRF 200637 s at fs.png
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_011213
RefSeq (білок)
NP_035343
Локус (UCSC) Хр. 1: 43.53 – 43.62 Mb Хр. 4: 118.21 – 118.29 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRF (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 907 амінокислот, а молекулярна маса — 212 879[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAPEPAPGRT MVPLVPALVM LGLVAGAHGD SKPVFIKVPE DQTGLSGGVA
SFVCQATGEP KPRITWMKKG KKVSSQRFEV IEFDDGAGSV LRIQPLRVQR
DEAIYECTAT NSLGEINTSA KLSVLEEEQL PPGFPSIDMG PQLKVVEKAR
TATMLCAAGG NPDPEISWFK DFLPVDPATS NGRIKQLRSG ALQIESSEES
DQGKYECVAT NSAGTRYSAP ANLYVRVRRV APRFSIPPSS QEVMPGGSVN
LTCVAVGAPM PYVKWMMGAE ELTKEDEMPV GRNVLELSNV VRSANYTCVA
ISSLGMIEAT AQVTVKALPK PPIDLVVTET TATSVTLTWD SGNSEPVTYY
GIQYRAAGTE GPFQEVDGVA TTRYSIGGLS PFSEYAFRVL AVNSIGRGPP
SEAVRARTGE QAPSSPPRRV QARMLSASTM LVQWEPPEEP NGLVRGYRVY
YTPDSRRPPN AWHKHNTDAG LLTTVGSLLP GITYSLRVLA FTAVGDGPPS
PTIQVKTQQG VPAQPADFQA EVESDTRIQL SWLLPPQERI IMYELVYWAA
EDEDQQHKVT FDPTSSYTLE DLKPDTLYRF QLAARSDMGV GVFTPTIEAR
TAQSTPSAPP QKVMCVSMGS TTVRVSWVPP PADSRNGVIT QYSVAYEAVD
GEDRGRHVVD GISREHSSWD LVGLEKWTEY RVWVRAHTDV GPGPESSPVL
VRTDEDVPSG PPRKVEVEPL NSTAVHVYWK LPVPSKQHGQ IRGYQVTYVR
LENGEPRGLP IIQDVMLAEA QWRPEESEDY ETTISGLTPE TTYSVTVAAY
TTKGDGARSK PKIVTTTGAV PGRPTMMIST TAMNTALLQW HPPKELPGEL
LGYRLQYCRA DEARPNTIDF GKDDQHFTVT GLHKGTTYIF RLAAKNRAGL
GEEFEKEIRT PEDLPSGFPQ NLHVTGLTTS TTELAWDPPV LAERNGRIIS
YTVVFRDINS QQELQNITTD TRFTLTGLKP DTTYDIKVRA WTSKGSGPLS
PSIQSRTMPV EQVFAKNFRV AAAMKTSVLL SWEVPDSYKS AVPFKILYNG
QSVEVDGHSM RKLIADLQPN TEYSFVLMNR GSSAGGLQHL VSIRTAPDLL
PHKPLPASAY IEDGRFDLSM PHVQDPSLVR WFYIVVVPID RVGGSMLTPR
WSTPEELELD ELLEAIEQGG EEQRRRRRQA ERLKPYVAAQ LDVLPETFTL
GDKKNYRGFY NRPLSPDLSY QCFVLASLKE PMDQKRYASS PYSDEIVVQV
TPAQQQEEPE MLWVTGPVLA VILIILIVIA ILLFKRKRTH SPSSKDEQSI
GLKDSLLAHS SDPVEMRRLN YQTPGMRDHP PIPITDLADN IERLKANDGL
KFSQEYESID PGQQFTWENS NLEVNKPKNR YANVIAYDHS RVILTSIDGV
PGSDYINANY IDGYRKQNAY IATQGPLPET MGDFWRMVWE QRTATVVMMT
RLEEKSRVKC DQYWPARGTE TCGLIQVTLL DTVELATYTV RTFALHKSGS
SEKRELRQFQ FMAWPDHGVP EYPTPILAFL RRVKACNPLD AGPMVVHCSA
GVGRTGCFIV IDAMLERMKH EKTVDIYGHV TCMRSQRNYM VQTEDQYVFI
HEALLEAATC GHTEVPARNL YAHIQKLGQV PPGESVTAME LEFKLLASSK
AHTSRFISAN LPCNKFKNRL VNIMPYELTR VCLQPIRGVE GSDYINASFL
DGYRQQKAYI ATQGPLAEST EDFWRMLWEH NSTIIVMLTK LREMGREKCH
QYWPAERSAR YQYFVVDPMA EYNMPQYILR EFKVTDARDG QSRTIRQFQF
TDWPEQGVPK TGEGFIDFIG QVHKTKEQFG QDGPITVHCS AGVGRTGVFI
TLSIVLERMR YEGVVDMFQT VKTLRTQRPA MVQTEDQYQL CYRAALEYLG
SFDHYAT

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані.

Література[ред.ред. код]

  • Streuli M., Krueger N.X., Hall L.R., Schlossman S.F., Saito H. (1988). A new member of the immunoglobulin superfamily that has a cytoplasmic region homologous to the leukocyte common antigen.. J. Exp. Med. 168. с. 1523 — 1530.  PubMed DOI:10.1084/jem.168.5.1523
  • Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain.. J. Mol. Biol. 343. с. 1207 — 1220.  PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14. 2004. с. 2121 — 2127.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Streuli M., Krueger N.X., Tsai A.Y.M., Saito H. (1989). A family of receptor-linked protein tyrosine phosphatases in humans and Drosophila.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86. с. 8698 — 8702.  PubMed DOI:10.1073/pnas.86.22.8698
  • Ahmad F., Goldstein B.J. (1997). Functional association between the insulin receptor and the transmembrane protein-tyrosine phosphatase LAR in intact cells.. J. Biol. Chem. 272. с. 448 — 457.  PubMed DOI:10.1074/jbc.272.11.7519
  • Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins.. J. Biol. Chem. 273. с. 15611 — 15620.  PubMed DOI:10.1074/jbc.273.25.15611

Примітки[ред.ред. код]

Див. також[ред.ред. код]

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.