PYGO1

PYGO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VP7, 2VPB, 2VPD, 2VPE, 2VPG
Ідентифікатори
Символи	PYGO1, pygopus family PHD finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606902 MGI: 1919385 HomoloGene: 41050 GeneCards: PYGO1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • protein localization to nucleus • spermatid nucleus differentiation • post-embryonic development • Wnt signaling pathway • hematopoietic progenitor cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • розвиток нирки • spermatid development • beta-catenin-TCF complex assembly • canonical Wnt signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26108	72135
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000034910
UniProt	Q9Y3Y4	Q9D0P5
RefSeq (мРНК)	NM_015617 NM_001330326 NM_001367806	NM_028116
RefSeq (білок)	NP_001317255 NP_056432 NP_001354735	NP_082392
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 9: 72.83 – 72.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PYGO1 (англ. Pygopus family PHD finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 45 116.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAENSPAPA		YKVSSHGGDS		GLDGLGGPGV		QLGSPDKKKR		KANTQGPSFP
PLSEYAPPPN		PNSDHLVAAN		PFDDNYNTIS		YKPLPSSNPY		LGPGYPGFGG
YSTFRMPPHV		PPRMSSPYCG		PYSLRNQPHP		FPQNPLGMGF		NRPHAFNFGP
HDNSSFGNPS		YNNALSQNVN		MPNQHFRQNP		AENFSQIPPQ		NASQVSNPDL
ASNFVPGNNS		NFTSPLESNH		SFIPPPNTFG		QAKAPPPKQD		FTQGATKNTN
QNSSAHPPHL		NMDDTVNQSN		IELKNVNRNN		AVNQENSRSS		STEATNNNPA
NGTQNKPRQP		RGAADACTTE		KSNKSSLHPN		RHGHSSSDPV		YPCGICTNEV
NDDQDAILCE		ASCQKWFHRI		CTGMTETAYG		LLTAEASAVW		GCDTCMADKD
VQLMRTRETF		GPSAVGSDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Hoffmans R., Basler K. (2007). BCL9-2 binds Arm/beta-catenin in a Tyr142-independent manner and requires Pygopus for its function in Wg/Wnt signaling. Mech. Dev. 124: 59—67. PMID 17113272 DOI:10.1016/j.mod.2006.09.006

Див. також

• Хромосома 15