RAB21

RAB21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YZT, 1YZU, 1Z08, 1Z0I, 2OT3
Ідентифікатори
Символи	RAB21, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 612398 MGI: 894308 HomoloGene: 8991 GeneCards: RAB21
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • ендосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • focal adhesion • vesicle membrane • Golgi membrane • Golgi cisterna membrane • trans-Golgi network • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • cytoplasmic side of plasma membrane • cytoplasmic side of early endosome membrane • Борозна розщеплення • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axon cytoplasm • гіалоплазма • early endosome membrane • early endosome • синапс Біологічний процес • positive regulation of receptor-mediated endocytosis • regulation of axon extension • anterograde axonal transport • regulation of exocytosis • positive regulation of dendrite morphogenesis • protein transport • positive regulation of early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23011	216344
Ensembl	ENSG00000080371	ENSMUSG00000020132
UniProt	Q9UL25	P35282
RefSeq (мРНК)	NM_014999	NM_024454
RefSeq (білок)	NP_055814	NP_077774
Локус (UCSC)	Хр. 12: 71.75 – 71.8 Mb	Хр. 10: 115.12 – 115.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB21 (англ. RAB21, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 225 амінокислот, а молекулярна маса — 24 348.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAGGGGGG		AAAAGRAYSF		KVVLLGEGCV		GKTSLVLRYC		ENKFNDKHIT
TLQASFLTKK		LNIGGKRVNL		AIWDTAGQER		FHALGPIYYR		DSNGAILVYD
ITDEDSFQKV		KNWVKELRKM		LGNEICLCIV		GNKIDLEKER		HVSIQEAESY
AESVGAKHYH		TSAKQNKGIE		ELFLDLCKRM		IETAQVDERA		KGNGSSQPGT
ARRGVQIIDD		EPQAQTSGGG		CCSSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang X., He X., Fu X.-Y., Chang Z. (2006). Varp is a Rab21 guanine nucleotide exchange factor and regulates endosome dynamics. J. Cell Sci. 119: 1053—1062. PMID 16525121 DOI:10.1242/jcs.02810
• Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798
• Delprato A., Lambright D.G. (2007). Structural basis for Rab GTPase activation by VPS9 domain exchange factors. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 406—412. PMID 17450153 DOI:10.1038/nsmb1232

Див. також

• Хромосома 12