RAB28

RAB28
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HXS, 3E5H
Ідентифікатори
Символи	RAB28, CORD18, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 612994 MGI: 1917285 HomoloGene: 3135 GeneCards: RAB28
Пов'язані генетичні захворювання
cone-rod dystrophy 18
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GDP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • клітинна мембрана • cell projection • Цитоскелет • мембрана • ciliary rootlet • внутрішньоклітинний Біологічний процес • toxin transport • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9364	100972
Ensembl	ENSG00000157869	ENSMUSG00000029128
UniProt	P51157	Q99KL7
RefSeq (мРНК)	NM_001017979 NM_001159601 NM_004249	NM_027295 NM_001310589 NM_001310590 NM_001310592
RefSeq (білок)	NP_001017979 NP_001153073 NP_004240	NP_001297518 NP_001297519 NP_001297521 NP_081571
Локус (UCSC)	Хр. 4: 13.36 – 13.48 Mb	Хр. 5: 41.78 – 41.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB28 (англ. RAB28, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 24 841.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSEEESQD		RQLKIVVLGD		GASGKTSLTT		CFAQETFGKQ		YKQTIGLDFF
LRRITLPGNL		NVTLQIWDIG		GQTIGGKMLD		KYIYGAQGVL		LVYDITNYQS
FENLEDWYTV		VKKVSEESET		QPLVALVGNK		IDLEHMRTIK		PEKHLRFCQE
NGFSSHFVSA		KTGDSVFLCF		QKVAAEILGI		KLNKAEIEQS		QRVVKADIVN
YNQEPMSRTV		NPPRSSMCAV		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee S.H., Baek K., Dominguez R. (2008). Large nucleotide-dependent conformational change in Rab28. FEBS Lett. 582: 4107—4111. PMID 19026641 DOI:10.1016/j.febslet.2008.11.008

Див. також

• Хромосома 4