RAB5B

RAB5B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HEI
Ідентифікатори
Символи	RAB5B, Rab-5B, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179514 MGI: 105938 HomoloGene: 104027 GeneCards: RAB5B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • GTP-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • ендосома • мембрана • Меланосома • endocytic vesicle • внутрішньоклітинний • early endosome • екзосома • клітинна мембрана • secretory granule membrane • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • anchored component of synaptic vesicle membrane Біологічний процес • regulation of endocytosis • antigen processing and presentation • endosome organization • plasma membrane to endosome transport • protein transport • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5869	19344
Ensembl	ENSG00000111540	ENSMUSG00000000711
UniProt	P61020	P61021
RefSeq (мРНК)	NM_001252036 NM_001252037 NM_002868	NM_011229 NM_177411
RefSeq (білок)	NP_001238965 NP_001238966 NP_002859	NP_803130
Локус (UCSC)	Хр. 12: 55.97 – 56 Mb	Хр. 10: 128.51 – 128.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB5B (англ. RAB5B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 23 707.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSRSTARPN		GQPQASKICQ		FKLVLLGESA		VGKSSLVLRF		VKGQFHEYQE
STIGAAFLTQ		SVCLDDTTVK		FEIWDTAGQE		RYHSLAPMYY		RGAQAAIVVY
DITNQETFAR		AKTWVKELQR		QASPSIVIAL		AGNKADLANK		RMVEYEEAQA
YADDNSLLFM		ETSAKTAMNV		NDLFLAIAKK		LPKSEPQNLG		GAAGRSRGVD
LHEQSQQNKS		QCCSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• Wilson D.B., Wilson M.P. (1992). Identification and subcellular localization of human rab5b, a new member of the ras-related superfamily of GTPases. J. Clin. Invest. 89: 996—1005. PMID 1541686 DOI:10.1172/JCI115683
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Callaghan J.M., Nixon S., Bucci C., Toh B.-H., Stenmark H. (1999). Direct interaction of EEA1 with Rab5b. Eur. J. Biochem. 265: 361—366. PMID 10491193 DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x

Див. також

• Хромосома 12