RABEP1

RABEP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P4U, 1TU3, 1X79, 4N3Y, 4N3Z, 4Q9U
Ідентифікатори
Символи	RABEP1, RAB5EP, RABPT5, rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603616 MGI: 1860236 HomoloGene: 3451 GeneCards: RABEP1
Онтологія гена Молекулярна функція • growth factor activity • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • protein domain specific binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endocytic vesicle • цитоплазма • recycling endosome • ендосома • early endosome • early endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • membrane fusion • GO:0097285 апоптоз • protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • vesicle-mediated transport • ендоцитоз • regulation of signaling receptor activity • Golgi to plasma membrane transport • protein localization to ciliary membrane • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9135	54189
Ensembl	ENSG00000029725	ENSMUSG00000020817
UniProt	Q15276	O35551
RefSeq (мРНК)	NM_001083585 NM_001291581 NM_001291582 NM_004703	NM_001291141 NM_001291142 NM_001291143 NM_019400
RefSeq (білок)	NP_001077054 NP_001278510 NP_001278511 NP_004694	NP_001278070 NP_001278071 NP_001278072 NP_062273
Локус (UCSC)	Хр. 17: 5.28 – 5.39 Mb	Хр. 11: 70.74 – 70.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RABEP1 (англ. Rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 99 290.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQPGPASQP		DVSLQQRVAE		LEKINAEFLR		AQQQLEQEFN		QKRAKFKELY
LAKEEDLKRQ		NAVLQAAQDD		LGHLRTQLWE		AQAEMENIKA		IATVSENTKQ
EAIDEVKRQW		REEVASLQAV		MKETVRDYEH		QFHLRLEQER		TQWAQYRESA
EREIADLRRR		LSEGQEEENL		ENEMKKAQED		AEKLRSVVMP		MEKEIAALKD
KLTEAEDKIK		ELEASKVKEL		NHYLEAEKSC		RTDLEMYVAV		LNTQKSVLQE
DAEKLRKELH		EVCHLLEQER		QQHNQLKHTW		QKANDQFLES		QRLLMRDMQR
MEIVLTSEQL		RQVEELKKKD		QEDDEQQRLN		KRKDHKKADV		EEEIKIPVVC
ALTQEESSAQ		LSNEEEHLDS		TRGSVHSLDA		GLLLPSGDPF		SKSDNDMFKD
GLRRAQSTDS		LGTSGSLQSK		ALGYNYKAKS		AGNLDESDFG		PLVGADSVSE
NFDTASLGSL		QMPSGFMLTK		DQERAIKAMT		PEQEETASLL		SSVTQGMESA
YVSPSGYRLV		SETEWNLLQK		EVHNAGNKLG		RRCDMCSNYE		KQLQGIQIQE
AETRDQVKKL		QLMLRQANDQ		LEKTMKDKQE		LEDFIKQSSE		DSSHQISALV
LRAQASEILL		EELQQGLSQA		KRDVQEQMAV		LMQSREQVSE		ELVRLQKDND
SLQGKHSLHV		SLQQAEDFIL		PDTTEALREL		VLKYREDIIN		VRTAADHVEE
KLKAEILFLK		EQIQAEQCLK		ENLEETLQLE		IENCKEEIAS		ISSLKAELER
IKVEKGQLES		TLREKSQQLE		SLQEIKISLE		EQLKKETAAK		ATVEQLMFEE
KNKAQRLQTE		LDVSEQVQRD		FVKLSQTLQV		QLERIRQADS		LERIRAILND
TKLTDINQLP		ET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• Stenmark H., Vitale G., Ulrich O., Zerial M. (1995). Rabaptin-5 is a direct effector of the small GTPase Rab5 in endocytic membrane fusion. Cell. 83: 423—432. PMID 8521472 DOI:10.1016/0092-8674(95)90120-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cosulich S.C., Horiuchi H., Zerial M., Clarke P.R., Woodman P.G. (1997). Cleavage of rabaptin-5 blocks endosome fusion during apoptosis. EMBO J. 16: 6182—6191. PMID 9321397 DOI:10.1093/emboj/16.20.6182
• Xiao G.-H., Shoarinejad F., Jin F., Golemis E.A., Yeung R.S. (1997). The tuberous sclerosis 2 gene product, tuberin, functions as a Rab5 GTPase activating protein (GAP) in modulating endocytosis. J. Biol. Chem. 272: 6097—6100. PMID 9045618 DOI:10.1074/jbc.272.10.6097
• Lippe R., Miaczynska M., Rybin V., Runge A., Zerial M. (2001). Functional synergy between Rab5 effector Rabaptin-5 and exchange factor Rabex-5 when physically associated in a complex. Mol. Biol. Cell. 12: 2219—2228. PMID 11452015 DOI:10.1091/mbc.12.7.2219
• Mattera R., Arighi C.N., Lodge R., Zerial M., Bonifacino J.S. (2003). Divalent interaction of the GGAs with the Rabaptin-5-Rabex-5 complex. EMBO J. 22: 78—88. PMID 12505986 DOI:10.1093/emboj/cdg015

Див. також

• Хромосома 17