RAD18

RAD18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MRE, 2MRF, 2Y43, 2YBF
Ідентифікатори
Символи	RAD18, RNF73, E3 ubiquitin protein ligase, RAD18 E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 605256 MGI: 1890476 HomoloGene: 48572 GeneCards: RAD18
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • polyubiquitin modification-dependent protein binding • Y-form DNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • damaged DNA binding • DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transferase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • single-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • site of double-strand break • центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • replication fork • центросома • Rad6-Rad18 complex • nuclear inclusion body • цитоскелет • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • protein monoubiquitination • response to UV • negative regulation of cell death • positive regulation of chromosome segregation • cellular response to DNA damage stimulus • postreplication repair • protein autoubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56852	58186
Ensembl	ENSG00000070950	ENSMUSG00000030254
UniProt	Q9NS91	Q9QXK2
RefSeq (мРНК)	NM_020165	NM_001167730 NM_021385 NM_001381931 NM_001381932 NM_001381933
RefSeq (білок)	NP_064550	NP_001161202 NP_067360 NP_001368860 NP_001368861 NP_001368862
Локус (UCSC)	Хр. 3: 8.78 – 8.96 Mb	Хр. 6: 112.6 – 112.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD18 (англ. RAD18, E3 ubiquitin protein ligase) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 495 амінокислот, а молекулярна маса — 56 223.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSLAESRWP		PGLAVMKTID		DLLRCGICFE		YFNIAMIIPQ		CSHNYCSLCI
RKFLSYKTQC		PTCCVTVTEP		DLKNNRILDE		LVKSLNFARN		HLLQFALESP
AKSPASSSSK		NLAVKVYTPV		ASRQSLKQGS		RLMDNFLIRE		MSGSTSELLI
KENKSKFSPQ		KEASPAAKTK		ETRSVEEIAP		DPSEAKRPEP		PSTSTLKQVT
KVDCPVCGVN		IPESHINKHL		DSCLSREEKK		ESLRSSVHKR		KPLPKTVYNL
LSDRDLKKKL		KEHGLSIQGN		KQQLIKRHQE		FVHMYNAQCD		ALHPKSAAEI
VREIENIEKT		RMRLEASKLN		ESVMVFTKDQ		TEKEIDEIHS		KYRKKHKSEF
QLLVDQARKG		YKKIAGMSQK		TVTITKEDES		TEKLSSVCMG		QEDNMTSVTN
HFSQSKLDSP		EELEPDREED		SSSCIDIQEV		LSSSESDSCN		SSSSDIIRDL
LEEEEAWEAS		HKNDLQDTEI		SPRQNRRTRA		AESAEIEPRN		KRNRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Tateishi S., Sakuraba Y., Masuyama S., Inoue H., Yamaizumi M. (2000). Dysfunction of human Rad18 results in defective postreplication repair and hypersensitivity to multiple mutagens. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 7927—7932. PMID 10884424 DOI:10.1073/pnas.97.14.7927
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Centore R.C., Yazinski S.A., Tse A., Zou L. (2012). Spartan/C1orf124, a reader of PCNA ubiquitylation and a regulator of UV-induced DNA damage response. Mol. Cell. 46: 625—635. PMID 22681887 DOI:10.1016/j.molcel.2012.05.020

Див. також

• Хромосома 3